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21番目のアミノ酸セレノシステインの蛋白質への取込み機構の立体構造基盤の解明と人工システムの構築

21番目のアミノ酸セレノシステインの蛋白質への取込み機構の立体構造基盤の解明と人工システムの構築
阐明第21位氨基酸硒代半胱氨酸掺入蛋白质机制的三维结构基础并构建人工系统
批准号:
04F04186
负责人:
神田 大輔
金额:
$1.54万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 2005

项目摘要

项目成果

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セレノシステインは酸化還元に関わる蛋白質の活性残基として働く.セレノシステインをコードするコドンは、通常終止コドンとして使用されているUGAである。原核生物の場合,終止コドンUGAの下流にSECIS(selenocysteine insertion sequence)と呼ばれる特殊なRNA配列が存在すると、UGAはセレノシステインを指定するコドンへと変化する。このとき、リボゾームのA-siteに結合するのはセレノシステイニルtRNASecであり、蛋白質の翻訳は終結せずにセレノシステインが取り込まれる。伸長因子SelBはtRNAを結合するN末端部分とSECISに特異的に結合するC末端部分からなる.昨年度は酢酸生産菌Moorella thermoacetica由来のSelBのC末端ドメインの一部であるRNA結合最小ドメイン(残基512-634C末端)とSECIS(ヘアピン構造RNA)の複合体の構造決定を行った.その結果DNAに結合する有名なウィングドヘリックス(WH)モチーフがSECIS RNAの先端にあるループ構造を新規の認識モードで結合することがわかった.また、SECISの結合によりSelB分子の構造変化は見られず、これまで提案されてきたSECIS結合によるSelBのN末端ドメインとC末端ドメインの協同的な働きは、リボソームを介するものである可能性が示唆された。そのため、本年度はSelBのより大きな領域の構造解析を進めるべく、C末端ドメイン全体とSECIS RNAとの複合体の結晶化に取り組んだ。その結果、2種類の条件で結晶が得られた。分子置換法による解析により、正しい解を得ることに成功した。初期解析を終了した段階であるが、予想外のSECIS RNAとSelBの結合様式が観察された。
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会议论文
ミトコンドリア代謝と栄養及びKlotho/FGF23連関の血管石灰化機序解明及び治療法開発
  • 批准号:
    24K10555
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
  • 资助金额:
    $2.91万
  • 财政年份:
    2024
  • 负责人:
    神田 大輔
  • 依托单位:
蛋白質の立体構造形成の物理化学基盤を残基レベルの自由エネルギー直線関係で理解する
  • 批准号:
    23K21298
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $2.66万
  • 财政年份:
    2024
  • 负责人:
    神田 大輔
  • 依托单位:
Residue-specific Linear Free Energy Relationship is the physicochemical basis of protein folding
  • 批准号:
    21H02448
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $10.98万
  • 财政年份:
    2021
  • 负责人:
    神田 大輔
  • 依托单位:
SH3ドメインに高親和性・特異的ペプチドの立体構造に基づいたライブラリデザイン
  • 批准号:
    16657045
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 资助金额:
    $1.09万
  • 财政年份:
    2004
  • 负责人:
    神田 大輔
  • 依托单位:
海外基金