Detecting selective sweeps along the Drosophila melanogaster X chromosome

Primäres Ziel dieses Projektes ist es， mit Hilfe von单核苷酸多态性（snp） abdr<s:1> cke der natrlichen selection（选择性扫描）of the Drosophila melanogaster zu lokalisieren。大足鸟类zunächst die genetische Variabilität f<e:2> . r .总基因组分析与研究进展。在《基因重组》杂志上发表的一篇文章中，研究人员发现了一组基因序列为40kb的染色体。Zwei Populationen werden verglichen：非洲种群和欧罗巴种群；letztere ist durch die postglaziale Ausbreitung von D. melanogaster在den letz10 000 - 15 000 Jahren的研究。Mit hilife研究了一种可能性比检验方法，在einem zweiten Schritt untersucht，以及在der Vergangenheit中分析了基因组- abschnitte在einuss der natrlichen selection gestanden haben。（Intensität des Selektionsereignisses） gemessen和die Target-Stelle der selektionesim Genom best。Die längerfristigen Ziele dieses Projektes sind, (i) Die Rate von vorteilhaften Substitutionen abzuschätzen (Die Parameter ist f<e:1> r Die Evolutionsbiologie von enormer Bedeutung, war aber bisher schwerzu messen), (ii) Die Gene zu identifizieren und zu analysieren, Die and der Adaptation von D. melanogaster and neue Habitate beillight sind。

Primäres Ziel dieses Projektes ist es, mit Hilfe von single nucleotide polymorphisms (SNPs) Abdrücke der natürlichen Selektion (selective sweeps) auf dem X-Chromosom von Drosophila melanogaster zu lokalisieren. Dazu wird zunächst die genetische Variabilität für eine grosse Anzahl von Genom-Abschnitten mittels Sequenzieren gemessen. Diese Messungen werden durchschnittlich alle 40 kb in jenem Bereich des X-Chromosoms vorgenommen, der eine mittlere bis hohe Rekombinationsrate aufweist. Zwei Populationen werden verglichen: Eine anzestrale Population von Afrika und eine Population von Europa; letztere ist durch die postglaziale Ausbreitung von D. melanogaster in den letzten 10 000 - 15 000 Jahren erst entstanden. Mit Hilfe eines likelihood-ratio-test wird dann in einem zweiten Schritt untersucht, welche der analysierten Genom-Abschnitte in der Vergangenheit unter dem Einfluss der natürlichen Selektion gestanden haben. Darüber hinaus wird mit diesem Verfahren der Selektionskoeffizient (Intensität des Selektionsereignisses) gemessen und die Target-Stelle der Selektion im Genom bestimmt. Die längerfristigen Ziele dieses Projektes sind, (i) die Rate von vorteilhaften Substitutionen abzuschätzen (dieser Parameter ist für die Evolutionsbiologie von enormer Bedeutung, war aber bisher schwer zu messen), und (ii) die Gene zu identifizieren und zu analysieren, die an der Adaptation von D. melanogaster an neue Habitate beteiligt sind.