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Epistatic kinship: A new approach to estimate genetic similarity of individuals and populations

Epistatic kinship: A new approach to estimate genetic similarity of individuals and populations
上位亲属关系:估计个体和群体遗传相似性的新方法
批准号:
5398402
负责人:
Professor Dr. Henner Simianer
金额:
$0.0万
依托单位国家:
德国
项目类别:
Research Grants
财政年份:
2003
资助国家:
德国
项目状态:
已结题
起止时间:
2002-12-31 至 2005-12-31

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
Der von Malécot vorgeschlagene Anchorage des Abstammungskoeffizienten(Kinship)als Wahrscheinlichkeit der Herkunftsgleichands von Allelen soll von der Einzelgenbetrachtung auf die Betrachtung von Chromosomensegmenten ausgedehnt韦尔登.这一结果与“上位亲属关系”有关,并与Z. B.交叉激活和遗传干扰。这是一种韦尔登关系的发展,“上位亲属关系”是在典型的亲属关系基础上发展起来的,韦尔登关系是可以发展的。“上位亲属关系”的概念可以作为一种韦尔登关系,它可以通过一个具有遗传突变和漂移基础的血缘韦尔登关系的德国社会群体的增长而被理解。Dies kann insbesondere für gentische planet zur Differenzierung von Rassen oder Subpopulationen innerhalb von Nutztierarten von Vorteil sein.该方法的改进使数据的模拟更加有效,韦尔登。Parallel sollen für sechs porcine Chromosomenregionen unterschedlicher Länge informative Sets von Single Nucleotide Polymorphism(SNP)-Markern entwickelt韦尔登.基于对这三种Göttinger小型猪实用基因韦尔登的个体和遗传学分析方法的示范,对这三种SNP集的分型进行了基础研究。
英文摘要
Der von Malécot vorgeschlagene Ansatz des Abstammungskoeffizienten (Kinship) als Wahrscheinlichkeit der Herkunftsgleichheit von Allelen soll von der Einzelgenbetrachtung auf die Betrachtung von Chromosomensegmenten ausgedehnt werden. Das resultierende Ähnlichkeitsmaß wird als "Epistatic Kinship" bezeichnet und ist von verschiedenen Faktoren wie z.B. der Crossing-Over-Aktivität und der genetischen Interferenz abhängig. Es soll ein Verfahren entwickelt werden, mit dem die "Epistatic Kinship" zwischen Individuen auf der Basis von Typisierungsergebnissen geschätzt werden kannn. Die mittlere "Epistatic Kinship" kann als Distanzmaß zwischen Populationen verwendet werden, wobei durch die Wahl der Segmentlänge eine deutlich bessere zeitliche Auflösung als mit den gängigen mutations- und driftbasierten Distanzmaßen erreicht werden kann. Dies kann insbesondere für phylogentische Studien zur Differenzierung von Rassen oder Subpopulationen innerhalb von Nutztierarten von Vorteil sein. Die entwickelten Methoden sollen zunächst anhand von simulierten Daten validiert werden. Parallel sollen für sechs porcine Chromosomenregionen unterschiedlicher Länge informative Sets von Single Nucleotide Polymorphism (SNP)-Markern entwickelt werden. Auf Grundlage der Typisierungsergebnisse für diese SNP-Sets soll die Methode exemplarisch für die individuelle und phylogenetische Analyse der drei Teilpopulationen des Göttinger Minischweins praktisch genutzt werden.
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会议论文
Entwicklung und Erprobung eines neuen Ansatzes zur Schätzung der effektiven Populationsgröße auf der Basis der Homozygotie von Chromosomensegmenten
  • 批准号:
    26068496
  • 项目类别:
    Research Grants
  • 资助金额:
    $0.0万
  • 财政年份:
    2006
  • 负责人:
    Professor Dr. Henner Simianer
  • 依托单位:
海外基金