Shotgun functional glycomics of heparan sulphate saccharides: generating diverse libraries to decode biological selectivity
Shotgun functional glycomics of heparan sulphate saccharides: generating diverse libraries to decode biological selectivity
批准号:
BB/I004343/1
负责人:
Jeremy Turnbull
金额:
$44.98万
依托单位:
依托单位国家:
英国
项目类别:
Research Grant
财政年份:
2011
资助国家:
英国
项目状态:
已结题
起止时间:
2011 至 --
中文摘要
复合糖(多糖)是一个高度多样化的分子家族,在生物过程中具有广泛的功能,包括细胞识别、黏附、细胞间通信和信号传递。对糖的研究--由特定细胞或组织表达的一整套多糖--是一个新兴领域,旨在了解糖的功能如何支撑人类生物学的复杂性,以及它们在疾病过程中的参与。蛋白质与多糖的选择性相互作用是其生物学功能的关键之一。出现了许多新技术来支持“糖组学”研究的发展--大规模研究多聚糖结构多样性,以及多聚糖与其匹配的蛋白质伙伴的选择性相互作用,这是其功能的基础。然而,这些方法并没有直接揭示功能特性,特别是对于某些复杂类别的多糖,如硫酸乙酰肝素(HS)家族的硫酸多糖,它们负责调节广泛的生物过程,包括生长因子信号、酶活性和细胞黏附。我们现在需要有工具来研究特定的结构如何控制特定的蛋白质来控制生物系统。在这个项目中,我们建议开发一种新的方法来解决这个问题,方法是生成一个具有广泛结构的新型HS糖链的大型文库,并在生物检测中筛选它们,然后对选定的结构进行分析。这将使我们能够第一次评估HS在较高吞吐量下的结构-活性关系。这种‘鸟枪式’文库方法将通过允许特定的糖链结构与特定的生物功能相匹配,为破译HS糖蛋白的功能提供一个强大且通用的新工具。在未来,这一战略可以提供新的信息,可转化为生物技术和药物开发方面的应用。
英文摘要
Complex sugars (glycans) are a highly diverse family of molecules with a broad range of functions in biological processes including cell recognition, adhesion, cell-cell communication and signalling. The study of the glycome - the entire set of glycans expressed by particular cells or tissues - is an emerging field which aims to understand how glycan functions underpin the complexity of human biology, and their involvement in disease processes. The selective interaction of proteins with glycans is one of the keys to their biological functions. A number of new technologies have emerged to support the development of 'glycomics' studies - large-scale studies of glycan structural diversity and the selective interactions of glycans with their matching protein partners which underpins their functions. However, these approaches do not directly reveal functional properties, especially for some complex classes of glycans like the heparan sulphate (HS) family of sulphated glycans which are responsible for regulation of a wide range of biological processes including growth factor signalling, enzyme activity and cell adhesion. We now need to have the tools to ask how specific structures control specific proteins to control biological systems. In this project we propose to develop a new approach to address this question by generating a large library of novel HS glycans with a wide range of structures, and screening them in biological assays, followed by analysis of selected structures. This will permit us to evaluate the structure-activity relationships of HS at higher throughput for the first time. This 'shotgun' library approach will provide a powerful and generic new tool for decoding the function of the HS glycome by allowing specific glycan structures to be matched to specific biological functions. In the future this strategy could provide new information that could be translated into applications in biotechnology and drug development.
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Composition, sequencing and ion mobility mass spectrometry of heparan sulfate-like octasaccharide isomers differing in glucuronic and iduronic acid content.
葡萄糖醛酸和艾杜糖醛酸含量不同的硫酸乙酰肝素类八糖异构体的组成、测序和离子淌度质谱分析。
DOI:
10.1255/ejms.1337
发表时间:
2015
期刊:
European journal of mass spectrometry (Chichester, England)
影响因子:
--
作者:
[Leary JA]
通讯作者:
Leary JA
DOI:
10.1371/journal.pone.0139853
发表时间:
2015
期刊:
PloS one
影响因子:
3.7
作者:
[Kalus I, Rohn S, Puvirajesinghe TM, Guimond SE, Eyckerman-Kölln PJ, Ten Dam G, van Kuppevelt TH, Turnbull JE, Dierks T]
通讯作者:
Dierks T
DOI:
10.1021/acs.analchem.0c02048
发表时间:
2020-08-04
期刊:
ANALYTICAL CHEMISTRY
影响因子:
7.4
作者:
[Lettow, Maike, Grabarics, Marko, Pagel, Kevin]
通讯作者:
Pagel, Kevin
DOI:
10.1039/c6mb00432f
发表时间:
2016-10-20
期刊:
Molecular bioSystems
影响因子:
--
作者:
[Ahmed YA, Yates EA, Moss DJ, Loeven MA, Hussain SA, Hohenester E, Turnbull JE, Powell AK]
通讯作者:
Powell AK
DOI:
10.1039/c4sc00298a
发表时间:
2014-01-01
期刊:
CHEMICAL SCIENCE
影响因子:
8.4
作者:
[Bromfield, Stephen M., Posocco, Paola, Smith, David K.]
通讯作者:
Smith, David K.
共 7 条
GlycoMatrix: Engineering Tunable Stem Cell Niches Enhanced with Glycosaminoglycan Instructive Cues
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批准号:EP/X018776/1
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项目类别:Research Grant
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资助金额:$25.76万
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财政年份:2023
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负责人:Jeremy Turnbull
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依托单位:
China-UK Partnership to Develop Biotechnology Applications of Novel Heparinoids and Sulfated Polysaccharides
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批准号:BB/K021281/1
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项目类别:Research Grant
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资助金额:$5.53万
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财政年份:2013
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负责人:Jeremy Turnbull
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依托单位:
Microarray bioassays for functional glycome screening
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批准号:BB/G024820/1
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项目类别:Research Grant
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资助金额:$14.66万
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财政年份:2009
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负责人:Jeremy Turnbull
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依托单位:
Extracellular Modulation of Multiprotein Signalling Complexes: Molecular Regulation of FGFR Signalling by Anosmin & Heparan Sulphate Proteoglycans
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批准号:BB/F006616/1
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项目类别:Research Grant
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资助金额:$40.76万
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财政年份:2008
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负责人:Jeremy Turnbull
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依托单位:
Evaluation of optimised heparins as novel therapeutics for Alzheimers Disease
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批准号:BB/D525713/1
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项目类别:Research Grant
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资助金额:$7.62万
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财政年份:2006
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负责人:Jeremy Turnbull
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依托单位:
Chemical intervention in heparan sulphate-dependent growth factor signalling systems using engineered heparin saccharides
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批准号:BB/D006325/1
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项目类别:Research Grant
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资助金额:$69.58万
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财政年份:2006
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负责人:Jeremy Turnbull
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依托单位:
国内基金
海外基金
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Got2基因对浆细胞样树突状细胞功能的调控及其在系统性红斑狼疮疾病中的作用研究
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批准号:82371801
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项目类别:面上项目
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资助金额:47.00万元
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批准年份:2023
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负责人:周海波
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依托单位:
利用CRISPR内源性激活Atoh1转录促进前庭毛细胞再生和功能重建
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批准号:82371145
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项目类别:面上项目
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资助金额:46.00万元
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批准年份:2023
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负责人:陶永
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依托单位:
SMC5-NSMCE2功能异常激活APSCs中p53/p16衰老通路导致脂肪萎缩和胰岛素抵抗的机制研究
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批准号:82371873
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项目类别:面上项目
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资助金额:50.00万元
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批准年份:2023
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负责人:乔洁
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依托单位:
基于再生运动神经路径优化Agrin作用促进损伤神经靶向投射的功能研究
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批准号:82371373
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项目类别:面上项目
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资助金额:49.00万元
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批准年份:2023
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负责人:沃雁
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依托单位:
基于密度泛函理论金原子簇放射性药物设计、制备及其在肺癌诊疗中的应用研究
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批准号:82371997
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项目类别:面上项目
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资助金额:48.00万元
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批准年份:2023
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负责人:张春富
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依托单位:
HK2乳酰化修饰介导巨噬细胞功能障碍在脓毒症中的作用及机制
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批准号:82372160
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项目类别:面上项目
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资助金额:49.00万元
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批准年份:2023
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负责人:陈峰
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依托单位:
OBSL1功能缺失导致多指(趾)畸形的分子机制及其临床诊断价值
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批准号:82372328
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项目类别:面上项目
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资助金额:49.00万元
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批准年份:2023
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负责人:项盈
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依托单位:
LTB4/BLT1轴调控NLRP3炎症小体对糖尿病认知功能障碍的作用研究
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批准号:82371213
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项目类别:面上项目
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资助金额:47.00万元
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批准年份:2023
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负责人:王修哲
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依托单位:
Identification and quantification of primary phytoplankton functional types in the global oceans from hyperspectral ocean color remote sensing
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批准号:--
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项目类别:--
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资助金额:160万元
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批准年份:2022
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负责人:李忠平
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依托单位:
浸润特性调制的统计热力学研究
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批准号:21173271
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项目类别:面上项目
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资助金额:58.0万元
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批准年份:2011
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负责人:周世琦
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依托单位: