PARALLELIZING COMPUTATIONALLY INTENSIVE PHYLOGENETIC ANALYSIS ROUTINES
PARALLELIZING COMPUTATIONALLY INTENSIVE PHYLOGENETIC ANALYSIS ROUTINES
批准号:
7601450
负责人:
HUGH B NICHOLAS
金额:
$0.03万
依托单位国家:
美国
项目类别:
财政年份:
2007
资助国家:
美国
项目状态:
已结题
起止时间:
2007-08-01 至 2008-07-31
关键词:
中文摘要
这个子项目是许多研究子项目中利用
资源由NIH/NCRR资助的中心拨款提供。子项目和
调查员(PI)可能从NIH的另一个来源获得了主要资金,
并因此可以在其他清晰的条目中表示。列出的机构是
该中心不一定是调查人员的机构。
通过以下方式收集分子序列数据方面的最新改进
分子生物学家和生物化学家带来了这两种能力
并需要对更大、更复杂的数据进行系统发育分析
集合,并执行分析以回答有关
生物有机体之间的关系。这个项目涉及到
利用MPI消息传递库实现PHYLIP包的并行化
使依赖自举的大规模系统发育研究成为
在适度的时间内对适度数量的
处理器。
英文摘要
This subproject is one of many research subprojects utilizing the
resources provided by a Center grant funded by NIH/NCRR. The subproject and
investigator (PI) may have received primary funding from another NIH source,
and thus could be represented in other CRISP entries. The institution listed is
for the Center, which is not necessarily the institution for the investigator.
The recent improvements in gathering molecular sequence data by
molecular biologists and biochemists has brought with it both the ability
and need to perform phylogenetic analyses on larger, more complex data
sets and to perform analyses to answer new kinds of questions about the
relationships among biological organisms. This project concerns the
parallization of Phylip package using the MPI message passing library to
enable large scale phylogenetic studies that rely on bootstrapping to be
performed within a moderate amount of time on a moderate number of
processors.
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会议论文
MARC: SUMMER INSTITUTE IN BIOINFORMATICS - JUNE 2010
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批准号:8364398
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项目类别:
-
资助金额:$0.11万
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财政年份:2011
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负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
NRBSC/PSC PSC MARC INTERNS
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批准号:8364393
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项目类别:
-
资助金额:$0.11万
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财政年份:2011
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负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
MARC - DEVELOPING BIOINFORMATICS PROGRAMS, JULY 2009
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批准号:8364394
-
项目类别:
-
资助金额:$0.11万
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财政年份:2011
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负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
MARC - DEVELOPING BIOINFORMATICS PROGRAMS, JULY 2008
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批准号:8171960
-
项目类别:
-
资助金额:$0.11万
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财政年份:2010
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负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
MARC - DEVELOPING BIOINFORMATICS PROGRAMS, JULY 2009
-
批准号:8171961
-
项目类别:
-
资助金额:$0.11万
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财政年份:2010
-
负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
MARC: SUMMER INSTITUTE IN BIOINFORMATICS - JUNE 2010
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批准号:8171965
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项目类别:
-
资助金额:$0.11万
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财政年份:2010
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负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
NRBSC/PSC PSC MARC INTERNS
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批准号:8171958
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项目类别:
-
资助金额:$0.11万
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财政年份:2010
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负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
PEURTO RICO BIOINFORMATICS WORKSHOP (APRIL 27-MAY1 2009)
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批准号:7956382
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项目类别:
-
资助金额:$8.71万
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财政年份:2009
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负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
MARC - DEVELOPING BIOINFORMATICS PROGRAMS, JULY 2008
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批准号:7956381
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项目类别:
-
资助金额:$0.08万
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财政年份:2009
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负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
JACKSON STATE BIOINFORMATICS WORKSHOP (APRIL 16-17, 2007)
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批准号:7956169
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项目类别:
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资助金额:$0.08万
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财政年份:2009
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负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
MARC - DEVELOPING BIOINFORMATICS PROGRAMS, JULY 9 - 20, 2007
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批准号:7956289
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项目类别:
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资助金额:$0.08万
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财政年份:2009
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负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
ANALYSIS OF TYROSINE SULFATION: HIV
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批准号:7956091
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项目类别:
-
资助金额:$0.08万
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财政年份:2009
-
负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
ANALYSIS OF TYROSINE SULFATION
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批准号:7723138
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项目类别:
-
资助金额:$0.05万
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财政年份:2008
-
负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
MARC - DEVELOPING BIOINFORMATICS PROGRAMS, JULY 9 - 20, 2007
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批准号:7723430
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项目类别:
-
资助金额:$0.05万
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财政年份:2008
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负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
PARALLELIZING COMPUTATIONALLY INTENSIVE PHYLOGENETIC ANALYSIS ROUTINES
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批准号:7723197
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项目类别:
-
资助金额:$0.05万
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财政年份:2008
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负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
MARC - DEVELOPING BIOINFORMATICS PROGRAMS, JULY 17-28, 2006
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批准号:7723305
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项目类别:
-
资助金额:$0.05万
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财政年份:2008
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负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
JACKSON STATE BIOINFORMATICS WORKSHOP (APRIL 16-17, 2007)
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批准号:7723307
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项目类别:
-
资助金额:$0.05万
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财政年份:2008
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负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
CORE RESEARCH GRANT
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批准号:7723100
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项目类别:
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资助金额:$0.05万
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财政年份:2008
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负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
CORE RESEARCH GRANT
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批准号:7601261
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项目类别:
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资助金额:$0.04万
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财政年份:2007
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负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
PREDICTING POTENTIAL OF VACCINE DEVELOPMENT AGAINST LEISHMANIA (L) MEXICANA PAR
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批准号:7601411
-
项目类别:
-
资助金额:$0.03万
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财政年份:2007
-
负责人:HUGH B NICHOLAS
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依托单位:
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TPLATE Complex通过胞吞调控CLV3-CLAVATA多肽信号模块维持干细胞稳态的分子机制研究
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批准号:32370337
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项目类别:面上项目
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批准年份:2023
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负责人:王杰
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依托单位:
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批准号:--
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30万元
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批准年份:2022
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负责人:郭子龙
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依托单位:
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批准号:--
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项目类别:青年科学基金项目
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资助金额:30万元
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批准年份:2022
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批准号:31971055
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项目类别:面上项目
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批准年份:2019
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负责人:刘莹莹
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依托单位:
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批准号:31872651
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项目类别:面上项目
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资助金额:60.0万元
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批准年份:2018
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负责人:张宪春
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批准号:81703747
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资助金额:20.0万元
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批准年份:2017
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负责人:薛冰洁
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依托单位:
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负责人:张媛媛
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依托单位:
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批准号:31360023
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项目类别:地区科学基金项目
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批准号:81370445
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