沙门氏菌严格宿主适应性的进化
批准号:
30970119
项目类别:
面上项目
资助金额:
35.0 万元
负责人:
刘树林
依托单位:
学科分类:
病原细菌学
结题年份:
2012
批准年份:
2009
项目状态:
已结题
项目参与者:
李飞峰、徐晖、李庆海、霍霄、王磊、刘佶、王春晓、徐华锋、刘栋楠
中文摘要
病原菌的宿主适应性是个很重要的生物学现象,关系到新病原体的出现、病原体致病特性的改变、宿主与病原体之间相互作用机制等领域的研究,与人类健康事业密切相关。然而,迄今人类对此了解非常有限。本项目以沙门氏菌为模型,探讨细菌宿主适应性进化的遗传学基础和分子机制。绝大多数的沙门氏菌可感染多种宿主,而伤寒沙门氏菌等少数血清型只感染人,鸡白痢沙门氏菌只感染禽类,等等。我们将通过全基因组序列分析比较广泛宿主和单一宿主沙门氏菌,鉴定出其间的基因组差异。我们设想,沙门氏菌的严格宿主适应性来源于2方面的遗传因素,包括主动(基因横向转移和突变)和被动(基因删除和退化)基因组进化事件。我们将对鉴定出的候选基因进行生物信息学预测,按其理论上的重要性排序,把候选基因在目标菌株上通过基因置换法敲入或敲除,进行动物实验,验证其在宿主适应性上发挥的作用。
英文摘要
病原菌的宿主适应性是个很重要的生物学现象,关系到新病原体的出现、病原体致病特性的改变、宿主与病原体之间相互作用机制等领域的研究,与人类健康事业密切相关。然而,迄今人类对此了解非常有限。绝大多数的沙门氏菌可感染多种宿主,而伤寒沙门氏菌等少数血清型只感染人,鸡白痢沙门氏菌只感染禽类,等等。我们设想,沙门氏菌的严格宿主适应性来源于2 方面的遗传因素,包括主动(基因横向转移和突变)和被动(基因删除和退化)基因组进化事件。本项目我们以沙门氏菌为模型,探讨了细菌宿主适应性进化的遗传学基础和分子机制。我们通过全基因组序列分析比较广泛宿主和单一宿主沙门氏菌,鉴定出其间的基因组差异,并对鉴定出的候选基因进行生物信息学预测,按其理论上的重要性排序,把候选基因在目标菌株上通过基因置换法敲入或敲除,最后进行动物实验,验证其在宿主适应性上发挥的作用。本课题组在分析鉴定出Salmonella paratyphi C基因组152个假基因的基础上,在S. pullorum基因组上鉴定出200多个假基因,为下一步与S. typhi, S. paratyphi A, S. gallinarum等沙门菌的基因组比较研究打下了良好基础。已经初步确定动物实验的候选基因,目前处于菌株构建阶段。与此同时,我们对代表性沙门菌的一系列致病因子进行了深入研究,从功能的角度为沙门菌宿主适应性分子机制的阐明做了重要的积累。
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Production of enterodiol from defatted flaxseeds through biotransformation by human intestinal bacteria.
通过人体肠道细菌生物转化脱脂亚麻籽生产肠二醇
DOI:
10.1186/1471-2180-10-115
发表时间:
2010-04-16
期刊:
BMC microbiology
影响因子:
4.2
作者:
[Wang CZ, Ma XQ, Yang DH, Guo ZR, Liu GR, Zhao GX, Tang J, Zhang YN, Ma M, Cai SQ, Ku BS, Liu SL]
通讯作者:
Liu SL
SPC-P1: a pathogenicity-associated prophage of Salmonella paratyphi C.
SPC-P1:丙型副伤寒沙门氏菌致病性相关原噬菌体
DOI:
10.1186/1471-2164-11-729
发表时间:
2010-12-30
期刊:
BMC genomics
影响因子:
4.4
作者:
[Zou QH, Li QH, Zhu HY, Feng Y, Li YG, Johnston RN, Liu GR, Liu SL]
通讯作者:
Liu SL
mutL as a genetic switch of bacterial mutability: turned on or off through repeat copy number changes
mutL 作为细菌突变性的遗传开关:通过重复拷贝数变化打开或关闭。
DOI:
10.1111/j.1574-6968.2010.02107.x
发表时间:
2010-11-01
期刊:
FEMS MICROBIOLOGY LETTERS
影响因子:
2.1
作者:
[Chen, Fang, Liu, Wei-Qiao, Liu, Shu-Lin]
通讯作者:
Liu, Shu-Lin
The type VI secretion system gene cluster of Salmonella typhimurium: Required for full virulence in mice
鼠伤寒沙门氏菌VI型分泌系统基因簇:对小鼠具有完全毒力所必需的
DOI:
10.1002/jobm.201200047
发表时间:
2013-07-01
期刊:
JOURNAL OF BASIC MICROBIOLOGY
影响因子:
3.1
作者:
[Liu, Ji, Guo, Ji-Tao, Liu, Shu-Lin]
通讯作者:
Liu, Shu-Lin
DOI:
--
发表时间:
--
期刊:
BMC Evolutionary Biology
影响因子:
3.4
作者:
[刘树林]
通讯作者:
刘树林
共 10 条
病原性细菌的基因组进化:物种形成的分子机制
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批准号:82020108022
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项目类别:国际(地区)合作与交流项目
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资助金额:248万元
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批准年份:2020
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负责人:刘树林
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依托单位:
病原性细菌的物种起源:遗传学基础和获取-适应模型
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批准号:81871623
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项目类别:面上项目
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资助金额:57.0万元
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批准年份:2018
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负责人:刘树林
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依托单位:
细菌病原性进化中两个关键步骤分子事件解析:致病因子的获得及基因组的适应性重构
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批准号:81671980
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项目类别:面上项目
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资助金额:70.0万元
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批准年份:2016
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负责人:刘树林
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依托单位:
以沙门菌为模型的半封闭基因池细菌物种概念:3Cs标准的实验验证
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批准号:81271786
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项目类别:面上项目
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资助金额:70.0万元
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批准年份:2012
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负责人:刘树林
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依托单位:
基因退化与宿主适应:伤寒沙门菌等单一宿主沙门菌动物感染模型的构建
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批准号:81030029
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项目类别:重点项目
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资助金额:225.0万元
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批准年份:2010
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负责人:刘树林
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依托单位:
国内基金
海外基金