Pathogenic variants that alter protein code often disrupt splicing.
Pathogenic variants that alter protein code often disrupt splicing.
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DOI：
10.1038/ng.3837
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发表时间：
2017-06
期刊：
影响因子：
30.8
通讯作者：
Fairbrother WG
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Soemedi R;Cygan KJ;Rhine CL;Wang J;Bulacan C;Yang J;Bayrak-Toydemir P;McDonald J;Fairbrother WG
缺乏从测序数据中识别致病变异的工具极大地限制了精准医学的前景。以前的研究表明，三分之一的疾病等位基因改变剪接。我们发现剪接缺陷在疾病中聚集（例如单倍不足基因）。我们使用大规模平行剪接试验（MaPSy）分析了4，964个已发表的致病外显子突变，显示与患者组织剪接的一致率为81%。约10%的外显子突变改变了剪接，主要是通过破坏剪接体组装的多个阶段。我们提出了第一个大规模的外显子剪接突变的表征，使用一种新的技术，有利于变异分类，跟上变异发现的步伐。
The lack of tools to identify causative variants from sequencing data greatly limits the promise of Precision Medicine. Previous studies suggest one-third of disease alleles alter splicing. We discovered that splicing defects cluster in diseases (e.g. haploinsufficient genes). We analyzed 4,964 published disease-causing exonic mutations using a Massively Parallel Splicing Assay (MaPSy) that showed 81% concordance rate with patient tissue splicing. ~10% of exonic mutations altered splicing, mostly by disrupting multiple stages of the spliceosome assembly. We present the first large-scale characterization of exonic splicing mutations using a novel technology that facilitates variant classification that keeps pace with variant discovery.
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影响因子：
7
作者：
Ke, Shengdong;Shang, Shulian;Chasin, Lawrence A.
通讯作者：
Chasin, Lawrence A.
影响因子：
14.9
作者：
Reichert, V;Moore, MJ
通讯作者：
Moore, MJ
影响因子：
12.3
作者：
Mort M;Sterne-Weiler T;Li B;Ball EV;Cooper DN;Radivojac P;Sanford JR;Mooney SD
通讯作者：
Mooney SD
影响因子：
64.8
作者：
通讯作者：
--
DOI：
10.1186/1748-7188-6-26
发表时间：
2011-11-24
期刊：
Algorithms for molecular biology : AMB
影响因子：
--
作者：
Lorenz R;Bernhart SH;Höner Zu Siederdissen C;Tafer H;Flamm C;Stadler PF;Hofacker IL
通讯作者：
Hofacker IL