Exhaled breath SARS-CoV-2 shedding patterns across variants of concern.
Exhaled breath SARS-CoV-2 shedding patterns across variants of concern.
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DOI：
10.1016/j.ijid.2022.07.069
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发表时间：
2022-10
影响因子：
8.4
通讯作者：
Peumans, Peter
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Raymenants, Joren;Duthoo, Wout;Stakenborg, Tim;Verbruggen, Bert;Verplanken, Julien;Feys, Jos;Van Duppen, Joost;Hanifa, Rabea;Marchal, Elisabeth;Lambrechts, Andy;Maes, Piet;Andre, Emmanuel;Van den Wijngaert, Nik;Peumans, Peter
我们进行了呼出气（EB）和鼻咽（NP）定量聚合酶链反应（qPCR）和NP快速抗原检测（NP RAT）的SARS-CoV-2感染的不同变体。我们将免疫初治的α感染患者（n = 11）和部分加强的omicron感染患者（n = 8）作为高风险接触者。我们比较了队列之间的峰值NP和EB qPCR循环时间（ct）值（Wilcoxon-Mann-Whitney检验）。使用Cochran Q检验比较三个感染阶段的检测阳性率。α和Omicron感染的NP ct峰值中位数分别为11.5（四分位距[IQR] 10.1-12.1）和12.2（IQR 11.1-15.3）。α和Omicron感染的峰值中值EB ct分别为25.2（IQR 24.5-26.9）和28.3（IQR 26.4-30.8）。NP（P = 0.19）或EB（P = 0.09）队列之间的分布无差异。EB组SARS-CoV-2脱落在第1天达到峰值（置信区间[CI] 0.0 - 4.5），NP组在第3天达到峰值（CI 1.5 - 6.0）。D 0-D1（P = 0.44）和D2-D 6（P = 1.0）时EB qPCR阳性率与NP qPCR阳性率相等。在D 0-D1（P = 0.003）和D2-D 6（P = 0.008），它取代了NP大鼠阳性。D 7 ~ D10时均低于两者（P < 0.001）。不同变体之间的EB峰值和鼻咽脱落相当。EB qPCR阳性匹配NP qPCR，并在感染的第一周取代NP RAT。
We performed exhaled breath (EB) and nasopharyngeal (NP) quantitative polymerase chain reaction (qPCR) and NP rapid antigen testing (NP RAT) of SARS-CoV-2 infections with different variants. We included immuno-naïve alpha-infected (n = 11) and partly boosted omicron-infected patients (n = 8) as high-risk contacts. We compared peak NP and EB qPCR cycle time (ct) values between cohorts (Wilcoxon-Mann-Whitney test). Test positivity was compared for three infection phases using Cochran Q test. Peak median NP ct was 11.5 (interquartile range [IQR] 10.1-12.1) for alpha and 12.2 (IQR 11.1-15.3) for omicron infections. Peak median EB ct was 25.2 (IQR 24.5-26.9) and 28.3 (IQR 26.4-30.8) for alpha and omicron infections, respectively. Distributions did not differ between cohorts for NP (P = 0.19) or EB (P = 0.09). SARS-CoV-2 shedding peaked on day 1 in EB (confidence interval [CI] 0.0 - 4.5) and day 3 in NP (CI 1.5 - 6.0). EB qPCR positivity equaled NP qPCR positivity on D0-D1 (P = 0.44) and D2-D6 (P = 1.0). It superseded NP RAT positivity on D0-D1 (P = 0.003) and D2-D6 (P = 0.008). It was inferior to both on D7-D10 (P < 0.001). Peak EB and nasopharynx shedding were comparable across variants. EB qPCR positivity matched NP qPCR and superseded NP RAT in the first week of infection.
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DOI：
10.2807/1560-7917.es.2021.26.37.2100824
发表时间：
2021-09
期刊：
Euro surveillance : bulletin Europeen sur les maladies transmissibles = European communicable disease bulletin
影响因子：
--
作者：
Blanquart F;Abad C;Ambroise J;Bernard M;Cosentino G;Giannoli JM;Débarre F
通讯作者：
Débarre F
十个科学原因支持SARS-COV-2的机载传播。
DOI：
10.1016/s0140-6736(21)00869-2
发表时间：
2021-05-01
期刊：
Lancet (London, England)
影响因子：
--
作者：
Greenhalgh T;Jimenez JL;Prather KA;Tufekci Z;Fisman D;Schooley R
通讯作者：
Schooley R
影响因子：
8.9
作者：
Giovannini G;Haick H;Garoli D
通讯作者：
Garoli D
DOI：
10.1016/s1473-3099(20)30985-3
发表时间：
2021-05
期刊：
The Lancet. Infectious diseases
影响因子：
--
作者：
Marks M;Millat-Martinez P;Ouchi D;Roberts CH;Alemany A;Corbacho-Monné M;Ubals M;Tobias A;Tebé C;Ballana E;Bassat Q;Baro B;Vall-Mayans M;G-Beiras C;Prat N;Ara J;Clotet B;Mitjà O
通讯作者：
Mitjà O
影响因子：
4.5
作者：
Julin CH;Robertson AH;Hungnes O;Tunheim G;Bekkevold T;Laake I;Aune IF;Killengreen MF;Strand TR;Rykkvin R;Dorenberg DH;Stene-Johansen K;Berg ES;Bodin JE;Oftung F;Steens A;Næss LM
通讯作者：
Næss LM