GenBank.
GenBank.
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DOI：
10.1093/nar/gkr1202
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发表时间：
2012-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Sayers EW
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Benson DA;Karsch-Mizrachi I;Clark K;Lipman DJ;Ostell J;Sayers EW
GenBank®是一个全面的数据库，包含超过25万个正式描述物种的公开可用核苷酸序列。这些序列主要通过单个实验室的提交和大规模测序项目的批量提交获得，包括全基因组霰弹枪（WGS）和环境采样项目。大多数提交是使用基于网络的BankIt或独立的Sequin程序进行的，并且在收到后由GenBank工作人员分配加入编号。与欧洲核苷酸档案（ENA）和日本DNA数据库（DDBJ）的日常数据交换确保了全球范围的覆盖。GenBank可通过NCBI Entrez检索系统访问，该系统集成了来自主要DNA和蛋白质序列数据库的数据，以及分类、基因组、图谱、蛋白质结构和结构域信息，以及PubMed上的生物医学期刊文献。BLAST提供GenBank和其他序列数据库的序列相似性搜索。完整的GenBank数据库每两个月发布一次，每日更新一次，可通过FTP获得。要访问基因库及其相关的检索和分析服务，请从NCBI主页开始：www.ncbi.nlm.nih.gov。
GenBank® is a comprehensive database that contains publicly available nucleotide sequences for more than 250 000 formally described species. These sequences are obtained primarily through submissions from individual laboratories and batch submissions from large-scale sequencing projects, including whole-genome shotgun (WGS) and environmental sampling projects. Most submissions are made using the web-based BankIt or standalone Sequin programs, and accession numbers are assigned by GenBank staff upon receipt. Daily data exchange with the European Nucleotide Archive (ENA) and the DNA Data Bank of Japan (DDBJ) ensures worldwide coverage. GenBank is accessible through the NCBI Entrez retrieval system, which integrates data from the major DNA and protein sequence databases along with taxonomy, genome, mapping, protein structure and domain information, and the biomedical journal literature via PubMed. BLAST provides sequence similarity searches of GenBank and other sequence databases. Complete bimonthly releases and daily updates of the GenBank database are available by FTP. To access GenBank and its related retrieval and analysis services, begin at the NCBI home page: www.ncbi.nlm.nih.gov.
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影响因子：
14.9
作者：
Benson DA;Cavanaugh M;Clark K;Karsch-Mizrachi I;Lipman DJ;Ostell J;Sayers EW
通讯作者：
Sayers EW
影响因子：
14.9
作者：
Kaminuma, Eli;Kosuge, Takehide;Nakamura, Yasukazu
通讯作者：
Nakamura, Yasukazu
影响因子：
14.9
作者：
Zhang, Z;Schaffer, AA;Altschul, SF
通讯作者：
Altschul, SF
影响因子：
14.9
作者：
Leinonen R;Akhtar R;Birney E;Bower L;Cerdeno-Tárraga A;Cheng Y;Cleland I;Faruque N;Goodgame N;Gibson R;Hoad G;Jang M;Pakseresht N;Plaister S;Radhakrishnan R;Reddy K;Sobhany S;Ten Hoopen P;Vaughan R;Zalunin V;Cochrane G
通讯作者：
Cochrane G
影响因子：
14.9
作者：
Shumway M;Cochrane G;Sugawara H
通讯作者：
Sugawara H