Xenbase: gene expression and improved integration.
Xenbase: gene expression and improved integration.
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DOI：
10.1093/nar/gkp953
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发表时间：
2010-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Vize PD
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Bowes JB;Snyder KA;Segerdell E;Jarabek CJ;Azam K;Zorn AM;Vize PD
Xenbase(www.Xenbase.org)是非洲爪哇和热带非洲爪哇的模式生物数据库，是非洲爪哇研究的主要基因组、发育数据和群落信息的集中资源。最近的改进包括将文献和交互选项卡添加到基因目录页面。增加了新的内容，包括一个关于基因表达模式的部分，该部分结合了文献、大型屏幕和社区提交的图像数据。基因表达数据通过表达式选项卡集成到基因目录中，并且还可以使用表达式搜索界面通过多个标准进行搜索。基因目录已经增长到包含超过15000个基因。与欧洲非洲爪哇研究中心(EXRC)的合作产生了一个库存中心部分，其中包含EXRC提供的蛙线数据。搜索和导航方面也进行了许多改进。Xenbase也是非洲爪哇解剖本体论的来源，也是非洲爪哇基因命名的信息交换所。
Xenbase (www.xenbase.org), the model organism database for Xenopus laevis and X. (Silurana) tropicalis, is the principal centralized resource of genomic, development data and community information for Xenopus research. Recent improvements include the addition of the literature and interaction tabs to gene catalog pages. New content has been added including a section on gene expression patterns that incorporates image data from the literature, large scale screens and community submissions. Gene expression data are integrated into the gene catalog via an expression tab and is also searchable by multiple criteria using an expression search interface. The gene catalog has grown to contain over 15 000 genes. Collaboration with the European Xenopus Research Center (EXRC) has resulted in a stock center section with data on frog lines supplied by the EXRC. Numerous improvements have also been made to search and navigation. Xenbase is also the source of the Xenopus Anatomical Ontology and the clearinghouse for Xenopus gene nomenclature.
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影响因子：
--
作者：
Segerdell E;Bowes JB;Pollet N;Vize PD
通讯作者：
Vize PD
影响因子：
14.9
作者：
Barrett T;Troup DB;Wilhite SE;Ledoux P;Rudnev D;Evangelista C;Kim IF;Soboleva A;Tomashevsky M;Marshall KA;Phillippy KH;Sherman PM;Muertter RN;Edgar R
通讯作者：
Edgar R
影响因子：
14.9
作者：
Bowes JB;Snyder KA;Segerdell E;Gibb R;Jarabek C;Noumen E;Pollet N;Vize PD
通讯作者：
Vize PD
影响因子：
7
作者：
Stein, LD;Mungall, C;Lewis, S
通讯作者：
Lewis, S
影响因子：
3
作者：
Gilchrist, Michael J.;Christensen, Mikkel B.;Papalopulu, Nancy
通讯作者：
Papalopulu, Nancy