Embryonic stem cell-based mapping of developmental transcriptional programs.
Embryonic stem cell-based mapping of developmental transcriptional programs.
复制标题
基于胚胎干细胞的发展转录程序的映射。
DOI：
10.1038/nmeth.1775
复制
发表时间：
2011-11-13
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Wichterle, Hynek
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Mazzoni, Esteban O.;Mahony, Shaun;Iacovino, Michelina;Morrison, Carolyn A.;Mountoufaris, George;Closser, Michael;Whyte, Warren A.;Young, Richard A.;Kyba, Michael;Gifford, David K.;Wichterle, Hynek
通过染色质免疫沉淀和测序（ChIP-seq）研究发育调节转录因子面临两个主要障碍：ChIP级抗体的可用性和获得足够数量的细胞。我们描述了一种通用的方法，通过结合胚胎干细胞的定向分化和标记蛋白的诱导表达来进行转录因子结合位点的全基因组分析。我们证明了它的实用性，通过映射运动神经元的规范涉及的转录因子。
Study of developmentally regulated transcription factors by chromatin immunoprecipitation and sequencing (ChIP-seq) faces two major obstacles: availability of ChIP grade antibodies and access to sufficient number of cells. We describe a versatile method for genome-wide analysis of transcription factor binding sites by combining directed differentiation of embryonic stem cells and inducible expression of tagged proteins. We demonstrate its utility by mapping transcription factors involved in motor neuron specification.
登录
查看更多内容
邮票：用于探索DNA结合基序相似性的网络工具。
影响因子：
14.9
作者：
Mahony, Shaun;Benos, Panayiotis V
通讯作者：
Benos, Panayiotis V
影响因子：
5.2
作者：
Iacovino, Michelina;Bosnakovski, Darko;Fey, Holger;Rux, Danielle;Bajwa, Gagan;Mahen, Elisabeth;Mitanoska, Ana;Xu, Zhaohui;Kyba, Michael
通讯作者：
Kyba, Michael
DOI：
10.1111/j.2517-6161.1995.tb02031.x
发表时间：
1995-01-01
影响因子：
5.8
作者：
BENJAMINI, Y;HOCHBERG, Y
通讯作者：
HOCHBERG, Y
影响因子：
16.2
作者：
Novitch, BG;Chen, AI;Jessell, TM
通讯作者：
Jessell, TM
影响因子：
12.3
作者：
Langmead B;Trapnell C;Pop M;Salzberg SL
通讯作者：
Salzberg SL