The complete chloroplast genome sequence of an invasive plant Solanum rostratum (Solanaceae).
The complete chloroplast genome sequence of an invasive plant Solanum rostratum (Solanaceae).
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入侵植物 Solanum rostratum（茄科）的完整叶绿体基因组序列
DOI：
10.1080/23802359.2020.1714506
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发表时间：
2020-01-14
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Qiu J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Shi X;Qiu J
摘要刺萼龙葵原产于新热带地区和美国西南部，是美洲、欧洲、亚洲、非洲和澳大利亚的入侵植物。然而，该物种的叶绿体（cp）基因组的信息是有限的。本研究中，我们获得了S.通过高通量下一代测序技术获得的喙状体。CP基因组全长155，559 bp，包含130个基因，其中蛋白质编码基因85个，tRNA基因37个，rRNA基因8个。色葡萄大喙草cp基因组GC含量为37.76%。基于CP PCG编码序列构建的系统发育树显示，S. rostratum和S.在茄属中，胡颓子属和胡颓子属彼此密切相关。
Abstract Solanum rostratum is native to Neotropics and southwestern United States and considered as an invasive plant in Americas, Europe, Asia, Africa, and Australia. However, information on the chloroplast (cp) genome of this species is limited. In this study, we present the complete chloroplast genome sequence of S. rostratum obtained by high-throughput nextgeneration sequencing technology. The whole cp genome was 155,559 bp long and comprised 130 genes, including 85 protein-coding genes, 37 tRNA genes, and eight rRNA genes. The S. rostratum cp genome had a GC content of 37.76%. Based on the concatenated coding sequences of cp PCGs, phylogenetic analysis showed that Phylogenetic tree revealed that S. rostratum and S. elaeagnifolium are closely related to each other within the genus Solanum.
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