Quantitative image analysis of microbial communities with BiofilmQ.
Quantitative image analysis of microbial communities with BiofilmQ.
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用BiofilmQ对微生物群落进行定量图像分析。
DOI：
10.1038/s41564-020-00817-4
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发表时间：
2021-03
影响因子：
28.3
通讯作者：
Drescher K
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Hartmann R;Jeckel H;Jelli E;Singh PK;Vaidya S;Bayer M;Rode DKH;Vidakovic L;Díaz-Pascual F;Fong JCN;Dragoš A;Lamprecht O;Thöming JG;Netter N;Häussler S;Nadell CD;Sourjik V;Kovács ÁT;Yildiz FH;Drescher K
生物膜是代表地球上高度丰富的微生物生命形式的微生物群落。在生物膜内部，表型和基因型变异发生在三维空间和时间中;因此，显微镜和定量图像分析对于阐明其功能至关重要。在这里，我们提出了BiofilmQ-一个全面的图像细胞仪软件工具，用于在三维空间和时间中对众多生物膜内部和整个生物膜特性进行自动化和高通量定量，分析和可视化。BiofilmQ是一种图像细胞术软件工具，可以对生物膜特性进行可视化、量化和分析，从而深入了解其结构和功能。
Biofilms are microbial communities that represent a highly abundant form of microbial life on Earth. Inside biofilms, phenotypic and genotypic variations occur in three-dimensional space and time; microscopy and quantitative image analysis are therefore crucial for elucidating their functions. Here, we present BiofilmQ—a comprehensive image cytometry software tool for the automated and high-throughput quantification, analysis and visualization of numerous biofilm-internal and whole-biofilm properties in three-dimensional space and time. BiofilmQ is an image cytometry software tool that enables the visualization, quantification and analysis of biofilm properties, providing insights into their structure and function.
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DOI：
10.1083/jcb.201004104
发表时间：
2010-05-31
期刊：
The Journal of cell biology
影响因子：
--
作者：
Linkert M;Rueden CT;Allan C;Burel JM;Moore W;Patterson A;Loranger B;Moore J;Neves C;Macdonald D;Tarkowska A;Sticco C;Hill E;Rossner M;Eliceiri KW;Swedlow JR
通讯作者：
Swedlow JR
细菌形态发生和细胞内时空动力学的高通量，子像素精确分析。
影响因子：
3.6
作者：
Sliusarenko O;Heinritz J;Emonet T;Jacobs-Wagner C
通讯作者：
Jacobs-Wagner C
影响因子：
2.2
作者：
Beyenal, H;Donovan, C;Harkin, G
通讯作者：
Harkin, G
影响因子：
3.6
作者：
Hartmann, Raimo;van Teeseling, Muriel C. F.;Drescher, Knut
通讯作者：
Drescher, Knut
影响因子：
3.8
作者：
Renslow, Ryan;Lewandowski, Zbigniew;Beyenal, Haluk
通讯作者：
Beyenal, Haluk