SilkSatDb: a microsatellite database of the silkworm, Bombyx mori.
SilkSatDb: a microsatellite database of the silkworm, Bombyx mori.
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DOI：
10.1093/nar/gki099
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发表时间：
2005-01-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Nagaraju J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Prasad MD;Muthulakshmi M;Arunkumar KP;Madhu M;Sreenu VB;Pavithra V;Bose B;Nagarajaram HA;Mita K;Shimada T;Nagaraju J
SilkSatDb（丝蛾微卫星数据库）（http://www.cdfd.org.in/silksatdb）是从丝蛾（Bombyx mori）的可用表达序列标签和全基因组鸟枪序列中提取的微卫星关系数据库。该数据库是通过使用 PHP 开发的简单而强大的基于 Web 的搜索工具呈现的。 SilkSatDb 还存储有关实验室开发和验证的引物的信息。用户可以检索有关微卫星和所使用协议的信息，以及这些微卫星的信息图和多态性状态。此外，该界面还与引物设计程序 Autoprimer 相结合，用户可以使用该程序为感兴趣的位点设计引物。
The SilkSatDb (silkmoth microsatellite database) (http://www.cdfd.org.in/silksatdb) is a relational database of microsatellites extracted from the available expressed sequence tags and whole genome shotgun sequences of the silkmoth, Bombyx mori. The database has been rendered with a simple and robust web-based search facility, developed using PHP. The SilkSatDb also stores information on primers developed and validated in the laboratory. Users can retrieve information on the microsatellite and the protocols used, along with informative figures and polymorphism status of those microsatellites. In addition, the interface is coupled with Autoprimer, a primer-designing program, using which users can design primers for the loci of interest.
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