The complete chloroplast genome of Primula beesiana, an ornamental alpine plant from SW China.
The complete chloroplast genome of Primula beesiana, an ornamental alpine plant from SW China.
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中国西南观赏高山植物报春花的完整叶绿体基因组
DOI：
10.1080/23802359.2019.1698377
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发表时间：
2019-12-12
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Huang Y
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Wu Z;Chen X;Zhang L;Huang Y
摘要报春花属多年生丛生高山植物。标题报春花科的繁殖科植物。在这里，第一个完整的叶绿体基因组被测定。甜菜叶绿体基因组全长为150873 ，GC含量为37.1%。重组基因组具有典型的四分体结构，其中大的单复制区为82850 ，小的单复制区为17,651 ，一对反向重复序列为25,186 。整个cp基因组共有137个基因，其中编码蛋白质的基因91个，rRNA基因8个，转移RNA(TRNA)基因38个，其中包括115个独特基因，81个独特的CDSS，30个独特的tRNAs和4个独特的rRNAs。系统进化树分析表明，甜菜夜蛾与球囊拟青霉亲缘关系较近。
Abstract Primula beesiana Forrest is a perennial rosette alpine species in the Sect. Proliferae of family Primulaceae. Here, the first complete chloroplast genome of P. beesiana was determined. The size of the complete chloroplast genome of P. beesiana is 150873 bp with GC content of 37.1%. The assembled genome has a typical quadripartite structure, containing a large single-copy (LSC) region was 82850 bp, a small single-copy (SSC) region was 17,651 bp, and a pair of inverted repeats (IRs) regions was 25,186 bp. There are 137 genes are annotated in the whole cp genome with 91 protein-coding genes, 8 rRNA genes, and 38 transfer RNA (tRNA) genes, including 115 unique genes, 81 unique CDSs, 30 unique tRNAs, and 4 unique rRNAs. The phylogenetic tree showed that P. beesiana is closely related to P. bulleyana.
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影响因子：
1.1
作者：
Huang, Yuan;Li, Naiwei;Ma, Yongpeng
通讯作者：
Ma, Yongpeng
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Nguyen LT;Schmidt HA;von Haeseler A;Minh BQ
通讯作者：
Minh BQ
影响因子：
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作者：
Katoh K;Standley DM
通讯作者：
Standley DM
DOI：
10.1093/bioinformatics/bts199
发表时间：
2012-06-15
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Kearse M;Moir R;Wilson A;Stones-Havas S;Cheung M;Sturrock S;Buxton S;Cooper A;Markowitz S;Duran C;Thierer T;Ashton B;Meintjes P;Drummond A
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Jermiin LS