Characterization of protein unfolding with solid-state nanopores.
Characterization of protein unfolding with solid-state nanopores.
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DOI：
10.2174/09298665113209990077
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发表时间：
2014-03
影响因子：
1.6
通讯作者：
Ledden B
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Li J;Fologea D;Rollings R;Ledden B
在这项工作中，我们回顾了以固态纳米孔为基础的设备表征的蛋白质展开过程。蛋白质分子在纳米孔中的占据或排除体积取决于蛋白质的构象或形状。折叠的蛋白质在纳米孔中具有更大的排除体积，因此它比其未折叠的形式阻止更多的离子电流流动，并产生更大的电流阻塞幅度。蛋白质在毛孔中停留的时间长短也取决于蛋白质的折叠状态。我们使用牛血清白蛋白(BSA)作为模型蛋白来讨论这种电流阻断幅度和与蛋白质展开过程相关的持续时间。在固态纳米孔中，BSA分子以折叠、部分展开和完全展开的构象进行了测量。我们讨论了用氮化硅纳米孔测量BSA蛋白展开的实验结果、数据分析和理论考虑。我们证明这种纳米孔方法能够在单分子水平上表征蛋白质的展开过程。还将讨论使用固态纳米孔设备表征蛋白质展开的问题和未来的研究。
In this work, we review the process of protein unfolding characterized by a solid-state nanopore based device. The occupied or excluded volume of a protein molecule in a nanopore depends on the protein’s conformation or shape. A folded protein has a larger excluded volume in a nanopore thus it blocks more ionic current flow than its unfolded form and produces a greater current blockage amplitude. The time duration a protein stays in a pore also depends on the protein’s folding state. We use Bovine Serum Albumin (BSA) as a model protein to discuss this current blockage amplitude and the time duration associated with the protein unfolding process. BSA molecules were measured in folded, partially unfolded, and completely unfolded conformations in solid-state nanopores. We discuss experimental results, data analysis, and theoretical considerations of BSA protein unfolding measured with silicon nitride nanopores. We show this nanopore method is capable of characterizing a protein’s unfolding process at single molecule level. Problems and future studies in characterization of protein unfolding using a solid-state nanopore device will also be discussed.
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影响因子：
17.1
作者：
Oukhaled, Abdelghani;Cressiot, Benjamin;Pelta, Juan
通讯作者：
Pelta, Juan
影响因子：
1.6
作者：
DEBLOIS, RW;BEAN, CP
通讯作者：
BEAN, CP
影响因子：
7.4
作者：
Freedman, Kevin J.;Jurgens, Maike;Kim, Min Jun
通讯作者：
Kim, Min Jun
DOI：
10.1088/0953-8984/22/45/454129
发表时间：
2010-11-17
期刊：
Journal of physics. Condensed matter : an Institute of Physics journal
影响因子：
--
作者：
Li J;Talaga DS
通讯作者：
Talaga DS
影响因子：
5.6
作者：
DAGGETT, V;LEVITT, M
通讯作者：
LEVITT, M