Microbial genomic analysis reveals the essential role of inflammation in bacteria-induced colorectal cancer.
Microbial genomic analysis reveals the essential role of inflammation in bacteria-induced colorectal cancer.
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DOI：
10.1038/ncomms5724
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发表时间：
2014-09-03
影响因子：
16.6
通讯作者：
Jobin, Christian
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Arthur, Janelle C.;Gharaibeh, Raad Z.;Muehlbauer, Marcus;Perez-Chanona, Ernesto;Uronis, Joshua M.;McCafferty, Jonathan;Fodor, Anthony A.;Jobin, Christian
炎症性肠病或结直肠癌(CRC)患者体内有大量的肠道细菌，尤其是大肠杆菌。然而，目前还不清楚癌症是由炎症诱导的大肠杆菌扩张和/或特定微生物基因表达的变化引起的。在这里，我们使用来自无菌小鼠的管腔微生物区系的纵向(2，12和20周)16SRRNA测序，表明发炎的Il10−/−小鼠比健康的野生型小鼠保持更多的肠杆菌科细菌。用单克隆的Il10−/−小鼠进行的实验表明，宿主炎症是大肠杆菌促癌活性所必需的。序列分析表明，Il10−/−小鼠的大肠杆菌基因目录发生了显著变化，这些变化主要是由于对肠道环境的适应所致。在促进肿瘤的大肠杆菌PKS岛上存在的特定基因的表达受炎症/CRC发展的调节。因此，I10−/−小鼠的炎症进展支持肠杆菌科细菌，并改变了对肿瘤发展至关重要的一小部分微生物基因。
Enterobacteria, especially Escherichia coli, are abundant in patients with inflammatory bowel disease or colorectal cancer (CRC). However, it is unclear whether cancer is promoted by inflammation-induced expansion of E. coli and/or changes in expression of specific microbial genes. Here we use longitudinal (2, 12 and 20 weeks) 16S rRNA sequencing of luminal microbiota from ex-germ free mice to show that inflamed Il10−/− mice maintain a higher abundance of Enterobacteriaceae than healthy wild-type mice. Experiments with mono-colonized Il10−/− mice reveal that host inflammation is necessary for E. coli cancer-promoting activity. RNA-sequence analysis indicates significant changes in E. coli gene catalogue in Il10−/− mice, with changes mostly driven by adaptation to the intestinal environment. Expression of specific genes present in the tumor-promoting E. coli pks island are modulated by inflammation/CRC development. Thus, progression of inflammation in Il10−/− mice supports Enterobacteriaceae and alters a small subset of microbial genes important for tumor development.
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影响因子：
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作者：
Langmead, Ben;Salzberg, Steven L.
通讯作者：
Salzberg, Steven L.
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通讯作者：
Holt, Robert A.
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作者：
Darfeuille-Michaud, A;Neut, C;Colombel, JF
通讯作者：
Colombel, JF
DOI：
10.1111/j.2517-6161.1995.tb02031.x
发表时间：
1995-01-01
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作者：
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通讯作者：
HOCHBERG, Y
DOI：
10.1126/science.1224820
发表时间：
2012-10-05
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Arthur JC;Perez-Chanona E;Mühlbauer M;Tomkovich S;Uronis JM;Fan TJ;Campbell BJ;Abujamel T;Dogan B;Rogers AB;Rhodes JM;Stintzi A;Simpson KW;Hansen JJ;Keku TO;Fodor AA;Jobin C
通讯作者：
Jobin C