Activated Ion Electron Transfer Dissociation for Improved Fragmentation of Intact Proteins.
Activated Ion Electron Transfer Dissociation for Improved Fragmentation of Intact Proteins.
复制标题
DOI：
10.1021/acs.analchem.5b00881
复制
发表时间：
2015-07-21
影响因子：
7.4
通讯作者：
Coon, Joshua J.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Riley, Nicholas M.;Westphall, Michael S.;Coon, Joshua J.
在此，我们报告了首次实施用于自上而下蛋白质表征的活化离子电子转移解离 (AI-ETD)，表明 AI-ETD 明确扩展了 ETD 可有效裂解完整蛋白质的 m/z 范围。 AI-ETD 利用与 ETD 反应同时进行的红外光子轰击来减轻非解离电子转移，该技术是使用一种新型多用途解离池进行的，该解离池可以在离子阱-Orbitrap 混合质谱仪上执行束型碰撞解离和离子-离子反应。与单独的 ETD 相比，AI-ETD 增加了所有电荷态的 c 型和 z 型产物离子数量，将低电荷密度前体的产物离子产率提高了近 4 倍。 AI-ETD 的性能也优于 HCD，为所研究的所有电荷状态下的所有蛋白质生成更多匹配片段。除了生成更多独特的碎片离子之外，与 HCD 和 ETD 相比，AI-ETD 还提供了更大的蛋白质序列覆盖率。总而言之，AI-ETD 在整个 m/z 谱上的有效性证明了其对完整蛋白质的稳健片段化的功效。
Here we report the first implementation of activated ion electron transfer dissociation (AI-ETD) for top down protein characterization, showing that AI-ETD definitively extends the m/z range over which ETD can be effective for fragmentation of intact proteins. AI-ETD, which leverages infrared photon bombardment concurrent to the ETD reaction to mitigate nondissociative electron transfer, was performed using a novel multipurpose dissociation cell that can perform both beam-type collisional dissociation and ion–ion reactions on an ion trap–Orbitrap hybrid mass spectrometer. AI-ETD increased the number of c- and z-type product ions for all charge states over ETD alone, boosting product ion yield by nearly 4-fold for low charge density precursors. AI-ETD also outperformed HCD, generating more matching fragments for all proteins at all charge states investigated. In addition to generating more unique fragment ions, AI-ETD provided greater protein sequence coverage compared to both HCD and ETD. In all, the effectiveness of AI-ETD across the entirety of the m/z spectrum demonstrates its efficacy for robust fragmentation of intact proteins.
登录
查看更多内容
DOI：
10.1016/j.bbrc.2014.02.041
发表时间：
2014-03-21
影响因子：
3.1
作者：
Catherman, Adam D.;Skinner, Owen S.;Kelleher, Neil L.
通讯作者：
Kelleher, Neil L.
DOI：
10.1016/j.jasms.2009.10.014
发表时间：
2010-02-01
影响因子：
3.2
作者：
Garcia, Benjamin A.
通讯作者：
Garcia, Benjamin A.
影响因子：
15
作者：
Breuker, K;Oh, HB;McLafferty, FW
通讯作者：
McLafferty, FW
影响因子：
7.4
作者：
McLuckey, SA;Reid, GE;Wells, JM
通讯作者：
Wells, JM
影响因子：
2.7
作者：
Coon, JJ;Syka, JEP;Hunt, DF
通讯作者：
Hunt, DF