Uncovering candidate genes involved in photosynthetic capacity using unexplored genetic variation in Spring Wheat.
Uncovering candidate genes involved in photosynthetic capacity using unexplored genetic variation in Spring Wheat.
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DOI：
10.1111/pbi.13568
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发表时间：
2021-08
影响因子：
13.8
通讯作者：
Hall A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Joynson R;Molero G;Coombes B;Gardiner LJ;Rivera-Amado C;Piñera-Chávez FJ;Evans JR;Furbank RT;Reynolds MP;Hall A
为了养活不断增长的人口，我们必须利用基因组学和表型学的进步来利用小麦育种群体的变异，比如光合作用能力，这些特征仍然没有得到优化。在这里，我们调查了一组不同的小麦种质，其中包含精英、渐渗和合成衍生品系，揭示了以前未描述的变异。我们展示了外来材料的战略整合如何缓解小麦D基因组的遗传瓶颈，使SNP率提高了62%，这主要是由于Ae。Tauschii合成小麦捐赠者。在整个小组中，67%的Ae。Tauschii捐赠者的基因组被代表为精英背景下的导入。我们展示了如何利用观察到的遗传变异和高光谱反射数据，通过关联分析来识别与光合作用能力相关的性状的候选基因。这证明了基因组方法在发现小麦隐藏变异方面的价值，以及这种变异如何有助于育种工作，并增加我们对复杂性状的理解。
To feed an ever‐increasing population we must leverage advances in genomics and phenotyping to harness the variation in wheat breeding populations for traits like photosynthetic capacity which remains unoptimized. Here we survey a diverse set of wheat germplasm containing elite, introgression and synthetic derivative lines uncovering previously uncharacterized variation. We demonstrate how strategic integration of exotic material alleviates the D genome genetic bottleneck in wheat, increasing SNP rate by 62% largely due to Ae. tauschii synthetic wheat donors. Across the panel, 67% of the Ae. tauschii donor genome is represented as introgressions in elite backgrounds. We show how observed genetic variation together with hyperspectral reflectance data can be used to identify candidate genes for traits relating to photosynthetic capacity using association analysis. This demonstrates the value of genomic methods in uncovering hidden variation in wheat and how that variation can assist breeding efforts and increase our understanding of complex traits.
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面包小麦叶片叶绿素荧光参数、叶绿素和类胡萝卜素含量与生物量和产量的数量性状位点及其染色体缺失箱分配。
DOI：
10.1007/s11032-013-9862-8
发表时间：
2013-06
期刊：
Molecular breeding : new strategies in plant improvement
影响因子：
--
作者：
Czyczyło-Mysza I;Tyrka M;Marcińska I;Skrzypek E;Karbarz M;Dziurka M;Hura T;Dziurka K;Quarrie SA
通讯作者：
Quarrie SA
影响因子：
13.8
作者：
Allen AM;Winfield MO;Burridge AJ;Downie RC;Benbow HR;Barker GL;Wilkinson PA;Coghill J;Waterfall C;Davassi A;Scopes G;Pirani A;Webster T;Brew F;Bloor C;Griffiths S;Bentley AR;Alda M;Jack P;Phillips AL;Edwards KJ
通讯作者：
Edwards KJ
影响因子：
1.2
作者：
Cingolani, Pablo;Platts, Adrian;Ruden, Douglas M.
通讯作者：
Ruden, Douglas M.
影响因子：
6.9
作者：
Colmer, TD;Flowers, TJ;Munns, R
通讯作者：
Munns, R
影响因子：
7.4
作者：
Danisman, Selahattin;van der Wal, Froukje;Immink, Richard G. H.
通讯作者：
Immink, Richard G. H.