Direct sequencing of small genomes on the Pacific Biosciences RS without library preparation.
Direct sequencing of small genomes on the Pacific Biosciences RS without library preparation.
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DOI：
10.2144/000113962
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发表时间：
2012-12
期刊：
影响因子：
2.7
通讯作者：
Swerdlow H
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Coupland P;Chandra T;Quail M;Reik W;Swerdlow H
我们在 Pacific Biosciences RS 测序仪 (PacBio) 上开发了一种针对小 DNA 分子的测序方法，无需标准文库制备。迄今为止，这种方法已应用于单链和双链病毒基因组、细菌质粒、用于 DNA 修饰分析的质粒载体模型以及覆盖整个细菌基因组的线性 DNA 片段的测序。使用直接测序可以从少至 1 ng 的 DNA 生成序列数据，与当前的方案相比具有显着优势，目前的方案通常需要 400-500 ng 的剪切 DNA 来进行文库制备。
We have developed a sequencing method on the Pacific Biosciences RS sequencer (the PacBio) for small DNA molecules that avoids the need for a standard library preparation. To date this approach has been applied toward sequencing single-stranded and double-stranded viral genomes, bacterial plasmids, plasmid vector models for DNA-modification analysis, and linear DNA fragments covering an entire bacterial genome. Using direct sequencing it is possible to generate sequence data from as little as 1 ng of DNA, offering a significant advantage over current protocols which typically require 400–500 ng of sheared DNA for the library preparation.
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DOI：
10.1056/nejmoa1106920
发表时间：
2011-08-25
期刊：
The New England journal of medicine
影响因子：
--
作者：
Rasko DA;Webster DR;Sahl JW;Bashir A;Boisen N;Scheutz F;Paxinos EE;Sebra R;Chin CS;Iliopoulos D;Klammer A;Peluso P;Lee L;Kislyuk AO;Bullard J;Kasarskis A;Wang S;Eid J;Rank D;Redman JC;Steyert SR;Frimodt-Møller J;Struve C;Petersen AM;Krogfelt KA;Nataro JP;Schadt EE;Waldor MK
通讯作者：
Waldor MK
DOI：
10.1080/15257770802260741
发表时间：
2008-09
期刊：
Nucleosides, nucleotides & nucleic acids
影响因子：
--
作者：
Korlach J;Bibillo A;Wegener J;Peluso P;Pham TT;Park I;Clark S;Otto GA;Turner SW
通讯作者：
Turner SW
影响因子：
3.4
作者：
Svara F;Rankin DJ
通讯作者：
Rankin DJ
影响因子：
4.4
作者：
Kube M;Schneider B;Kuhl H;Dandekar T;Heitmann K;Migdoll AM;Reinhardt R;Seemüller E
通讯作者：
Seemüller E
影响因子：
3.5
作者：
Schadt, Eric E.;Turner, Steve;Kasarskis, Andrew
通讯作者：
Kasarskis, Andrew