Biological imaging software tools.
Biological imaging software tools.
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DOI：
10.1038/nmeth.2084
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发表时间：
2012-06-28
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Carpenter, Anne E.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Eliceiri, Kevin W.;Berthold, Michael R.;Goldberg, Ilya G.;Ibanez, Luis;Manjunath, B. S.;Martone, Maryann E.;Murphy, Robert F.;Peng, Hanchuan;Plant, Anne L.;Roysam, Badrinath;Stuurmann, Nico;Swedlow, Jason R.;Tomancak, Pavel;Carpenter, Anne E.
在现代生物实验室中，很少有技术比成像技术更普遍。光学技术和仪器的最新进展提供了迄今无法想象的能力。几乎所有这些进步都需要开发软件来实现成像数据的采集、管理、分析和可视化。我们回顾了生物学家在处理数字图像时遇到的每个计算步骤，该领域的挑战，以及生物图像信息学可用软件的总体状况，重点是开源选项。
Few technologies are more widespread in modern biological laboratories than imaging. Recent advances in optical technologies and instrumentation are providing hitherto unimagined capabilities. Almost all these advances have required the development of software to enable the acquisition, management, analysis, and visualization of the imaging data. We review each computational step that biologists encounter when dealing with digital images, the challenges in that domain, and the overall status of available software for bioimage informatics, focusing on open source options.
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影响因子：
48
作者：
Conrad, Christian;Wuensche, Annelie;Tan, Tze Heng;Bulkescher, Jutta;Sieckmann, Frank;Verissimo, Fatima;Edelstein, Arthur;Walter, Thomas;Liebel, Urban;Pepperkok, Rainer;Ellenberg, Jan
通讯作者：
Ellenberg, Jan
影响因子：
12.3
作者：
Carpenter AE;Jones TR;Lamprecht MR;Clarke C;Kang IH;Friman O;Guertin DA;Chang JH;Lindquist RA;Moffat J;Golland P;Sabatini DM
通讯作者：
Sabatini DM
影响因子：
5.6
作者：
Goff SA;Vaughn M;McKay S;Lyons E;Stapleton AE;Gessler D;Matasci N;Wang L;Hanlon M;Lenards A;Muir A;Merchant N;Lowry S;Mock S;Helmke M;Kubach A;Narro M;Hopkins N;Micklos D;Hilgert U;Gonzales M;Jordan C;Skidmore E;Dooley R;Cazes J;McLay R;Lu Z;Pasternak S;Koesterke L;Piel WH;Grene R;Noutsos C;Gendler K;Feng X;Tang C;Lent M;Kim SJ;Kvilekval K;Manjunath BS;Tannen V;Stamatakis A;Sanderson M;Welch SM;Cranston KA;Soltis P;Soltis D;O'Meara B;Ane C;Brutnell T;Kleibenstein DJ;White JW;Leebens-Mack J;Donoghue MJ;Spalding EP;Vision TJ;Myers CR;Lowenthal D;Enquist BJ;Boyle B;Akoglu A;Andrews G;Ram S;Ware D;Stein L;Stanzione D
通讯作者：
Stanzione D
影响因子：
3
作者：
Kremer, JR;Mastronarde, DN;McIntosh, JR
通讯作者：
McIntosh, JR
影响因子：
2.7
作者：
Collins, Tony J.
通讯作者：
Collins, Tony J.