NCBI GEO: archive for functional genomics data sets--update.
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DOI：
10.1093/nar/gks1193
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发表时间：
2013-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Soboleva A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Barrett T;Wilhite SE;Ledoux P;Evangelista C;Kim IF;Tomashevsky M;Marshall KA;Phillippy KH;Sherman PM;Holko M;Yefanov A;Lee H;Zhang N;Robertson CL;Serova N;Davis S;Soboleva A
基因表达综合库（GEO，http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/）是研究界提交的高通量微阵列和下一代序列功能基因组数据集的国际公共存储库。该资源支持对原始数据、处理后的数据和元数据进行归档，这些数据可以索引、交叉链接和可搜索。所有数据都可以多种格式免费下载。 GEO还提供了多种基于网络的工具和策略来帮助用户查询、分析和可视化数据。本文报告了数据库的现状和最新发展，包括 GEO2R 的发布，这是一个基于 R 的 Web 应用程序，可帮助用户分析 GEO 数据。
The Gene Expression Omnibus (GEO, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/) is an international public repository for high-throughput microarray and next-generation sequence functional genomic data sets submitted by the research community. The resource supports archiving of raw data, processed data and metadata which are indexed, cross-linked and searchable. All data are freely available for download in a variety of formats. GEO also provides several web-based tools and strategies to assist users to query, analyse and visualize data. This article reports current status and recent database developments, including the release of GEO2R, an R-based web application that helps users analyse GEO data.
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Barrett T;Troup DB;Wilhite SE;Ledoux P;Evangelista C;Kim IF;Tomashevsky M;Marshall KA;Phillippy KH;Sherman PM;Muertter RN;Holko M;Ayanbule O;Yefanov A;Soboleva A
通讯作者：
Soboleva A