Novel Bovine Papillomavirus Type Discovered by Rolling-Circle Amplification Coupled with Next-Generation Sequencing.
Novel Bovine Papillomavirus Type Discovered by Rolling-Circle Amplification Coupled with Next-Generation Sequencing.
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DOI：
10.1371/journal.pone.0162345
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发表时间：
2016
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Canal CW
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
da Silva FR;Cibulski SP;Daudt C;Weber MN;Guimarães LL;Streck AF;Mayer FQ;Roehe PM;Canal CW
目前，牛乳头瘤病毒（BPV）已被鉴定为15种类型，并分为4个属：Deltapapillomavirus、Epsilonpapillomavirus、Dyoxipillomavirus和Xipillomavirus。在这里，完整的基因组序列的一个新的BPV类型（BPV 04AC 14）从乳头状瘤病变恢复的报告。基因组长度为7，282 bp，具有乳头瘤病毒科成员的经典遗传组织和基序。最大似然系统发育分析表明，BPV 04AC 14与Xipapillomavirus属的成员聚类。新型BPV的L1衣壳蛋白的核苷酸序列与其对应物BPV3密切相关，与BPV3具有79%的相似性。这些结果表明，该病毒是一个新的BPV型的Xipapillomavirus属。
Currently, fifteen bovine papillomavirus (BPV) types have been identified and classified into four genera: Deltapapillomavirus, Epsilonpapillomavirus, Dyoxipapillomavirus, and Xipapillomavirus. Here, the complete genome sequence of a new BPV type (BPV 04AC14) recovered from a papillomatous lesion is reported. The genome is 7,282 bp in length and exhibits the classic genetic organization and motifs of the members of Papillomaviridae. Maximum likelihood phylogenetic analyses revealed that BPV 04AC14 clusters with members of the Xipapillomavirus genus. The nucleotide sequence of the L1 capsid protein of the novel BPV is closely related to its counterpart, BPV3, with which it shares 79% similarity. These findings suggest that this virus is a new BPV type of the Xipapillomavirus genus.
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