Comparative studies of the 3'-terminal sequences of several alpha virus RNAs.
Comparative studies of the 3'-terminal sequences of several alpha virus RNAs.
复制标题
几种甲病毒RNA 3末端序列的比较研究。
DOI：
10.1016/0042-6822(81)90499-2
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发表时间：
1981
期刊：
影响因子：
3.7
通讯作者：
Strauss,JH
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Ou,JH;Strauss,EG;Strauss,JH
采用逆转录酶链终止测序方法对辛德比斯病毒的 26 S RNA 以及辛德比斯病毒、塞姆利基森林病毒和米德尔堡病毒的病毒体 49 S RNA 的 3' 末端进行了测序。辛德比斯病毒的 49 S 和 26 S RNA 均具有相同的 3' 末端序列，其中至少有 146 个来自聚腺苷酸 (poly(A)) 的核苷酸。已知26S RNA是位于或靠近49S RNA 3'端的亚基因组RNA；我们目前的结果表明 26 S 和 49 S RNA 是共末端的。所有三种病毒的 49 S RNA 都包含与聚腺苷酸 (poly(A)) 相邻的 20 个核苷酸的区域，该区域是高度保守的。该保守序列可以是复制酶识别位点和/或用于衣壳化的识别位点。在这个保守区域之后，辛德比斯和塞姆利基森林病毒的序列显着不同，但在这些区域中似乎确实存在一些残余序列同源性。辛德毕斯病毒和塞姆利基森林病毒RNA的3′端含有较高含量的A和U；与 Poly(A) 尾相邻的前 50 个核苷酸中，一半以上是 U，四分之一以上是 A。此外，3' 末端存在重复序列。
The 3′-termini of 26 S RNA of Sindbis virus and of the virion 49 S RNAs of Sindbis virus, Semliki Forest virus, and Middelburg virus have been sequenced by using a chain-terminating sequencing method with reverse transcriptase. Both 49 S and 26 S RNAs of Sindbis virus have identical 3′-terminal sequence for at least 146 nucleotides from the poly(A) tracts. The 26 S RNA is known to be a subgenomic RNA located at or near the 3′-end of 49 S RNA; our present results indicate that 26 S and 49 S RNA are coterminal. The 49 S RNAs of all three viruses contain a region of 20 nucleotides adjacent to the poly(A) which is highly conserved. This conserved sequence could be the replicase recognition site and/or a recognition site for encapsidation. After this conserved region the sequences of Sindbis and of Semliki Forest virus diverge significantly but there does appear to be some residual sequence homology in these regions. The 3′-termini of Sindbis virus and Semliki Forest virus RNAs contain a high content of A and U; of the first 50 nucleotides adjacent to the poly(A) tail over half are U and over one quarter are A. In addition repeating sequences are present in the 3′-termini.
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