Structural basis of transcription initiation.
Structural basis of transcription initiation.
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DOI：
10.1126/science.1227786
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发表时间：
2012-11-23
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Ebright RH
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhang Y;Feng Y;Chatterjee S;Tuske S;Ho MX;Arnold E;Ebright RH
在转录起始期间，RNA聚合酶（RNAP）结合并解旋启动子DNA以形成RNAP-启动子开放复合物。我们已经确定了功能性转录起始复合物的晶体结构，其包含嗜热栖热菌RNA聚合酶，σA和对应于RNAP启动子开放复合物的转录泡和下游dsDNA的启动子DNA片段。结构表明，σ通过相互作用识别-10元件和n-10元件，包括解堆叠和插入三个DNA碱基的口袋，RNAP通过相互作用识别−4/+2区域，包括解堆叠和插入+2碱基的口袋。这些结构进一步表明，σ和模板链ssDNA之间的相互作用预组织模板链ssDNA以接合RNAP活性中心。
During transcription initiation, RNA polymerase (RNAP) binds and unwinds promoter DNA to form an RNAP-promoter open complex. We have determined crystal structures at 2.9 and 3.0 Å resolution of functional transcription initiation complexes comprising Thermus thermophilus RNA polymerase, σA, and a promoter DNA fragment corresponding to the transcription bubble and downstream dsDNA of the RNAP-promoter open complex. The structures show that σ recognizes the -10 element and discriminator element through interactions that include the unstacking and insertion into pockets of three DNA bases, and that RNAP recognizes the −4/+2 region through interactions that include the unstacking and insertion into a pocket of the +2 base. The structures further show that interactions between σ and template-strand ssDNA pre-organize template-strand ssDNA to engage the RNAP active center.
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