TopoGSA: network topological gene set analysis.
TopoGSA: network topological gene set analysis.
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DOI：
10.1093/bioinformatics/btq131
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发表时间：
2010-05-01
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Valencia A
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Glaab E;Baudot A;Krasnogor N;Valencia A
总结：TopoGSA（基于拓扑的基因集分析）是一个网络应用程序，致力于计算和可视化分子相互作用网络中基因和蛋白质集的网络拓扑特性。不同的拓扑特征，如网络中节点的中心性或它们形成簇的趋势，可以被计算并与已知的细胞通路和过程进行比较。可用性：可在http://www.infobiotics.net/topogsa上免费获取联系方式：nxk@cs.nott.ac.uk; avalencia@cnio.es
Summary: TopoGSA (Topology-based Gene Set Analysis) is a web-application dedicated to the computation and visualization of network topological properties for gene and protein sets in molecular interaction networks. Different topological characteristics, such as the centrality of nodes in the network or their tendency to form clusters, can be computed and compared with those of known cellular pathways and processes. Availability: Freely available at http://www.infobiotics.net/topogsa Contact: nxk@cs.nott.ac.uk; avalencia@cnio.es
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DOI：
10.1038/nrc1299
发表时间：
2004-03
期刊：
Nature reviews. Cancer
影响因子：
--
作者：
通讯作者：
--
影响因子：
14.9
作者：
Xenarios, I;Rice, DW;Eisenberg, D
通讯作者：
Eisenberg, D
影响因子：
14.9
作者：
Peri, S;Navarro, JD;Pandey, A
通讯作者：
Pandey, A
影响因子：
14.9
作者：
Mewes, HW;Heumann, K;Frishman, D
通讯作者：
Frishman, D
Biogrid：交互数据集的一般存储库。
影响因子：
14.9
作者：
Stark, Chris;Breitkreutz, Bobby-Joe;Reguly, Teresa;Boucher, Lorrie;Breitkreutz, Ashton;Tyers, Mike
通讯作者：
Tyers, Mike