Development and use of Ontologies Inside the Neuroscience Information Framework: A Practical Approach.
Development and use of Ontologies Inside the Neuroscience Information Framework: A Practical Approach.
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DOI：
10.3389/fgene.2012.00111
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发表时间：
2012
影响因子：
3.7
通讯作者：
Martone ME
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Imam FT;Larson SD;Bandrowski A;Grethe JS;Gupta A;Martone ME
神经科学信息框架 (NIF) 项目是 NIH 神经科学研究蓝图的一项举措，它通过开源、语义增强的搜索门户实现发现和访问全球公共研究数据和工具，从而推动神经科学的发展。 NIF 标准化本体 (NIFSTD) 是整个 NIF 系统的关键组成部分之一，提供了大量标准神经科学概念及其同义词和关系。 NIFSTD 本体中定义的知识模型能够对 NIF 生产系统中异构类型的网络可访问信息实体进行有效的基于概念的搜索。 NIFSTD 涵盖神经科学的主要领域，包括疾病、脑解剖学、细胞类型、亚细胞解剖学、小分子、技术和资源描述符。自 2008 年首次发布产品以来，NIF 在内容和功能方面有了显着增长，特别是在驱动 NIF 系统的本体和基于本体的服务方面。我们在此介绍 NIFSTD 本体的结构、设计原则、社区参与和现状。
An initiative of the NIH Blueprint for neuroscience research, the Neuroscience Information Framework (NIF) project advances neuroscience by enabling discovery and access to public research data and tools worldwide through an open source, semantically enhanced search portal. One of the critical components for the overall NIF system, the NIF Standardized Ontologies (NIFSTD), provides an extensive collection of standard neuroscience concepts along with their synonyms and relationships. The knowledge models defined in the NIFSTD ontologies enable an effective concept-based search over heterogeneous types of web-accessible information entities in NIF’s production system. NIFSTD covers major domains in neuroscience, including diseases, brain anatomy, cell types, sub-cellular anatomy, small molecules, techniques, and resource descriptors. Since the first production release in 2008, NIF has grown significantly in content and functionality, particularly with respect to the ontologies and ontology-based services that drive the NIF system. We present here on the structure, design principles, community engagement, and the current state of NIFSTD ontologies.
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影响因子：
3
作者：
Gardner, Daniel;Goldberg, David H.;Grafstein, Bernice;Robert, Adrian;Gardner, Esther P.
通讯作者：
Gardner, Esther P.
影响因子：
3
作者：
Gupta, Amarnath;Bug, William;Marenco, Luis;Qian, Xufei;Condit, Christopher;Rangarajan, Arun;Mueller, Hans Michael;Miller, Perry L.;Sanders, Brian;Grethe, Jeffrey S.;Astakhov, Vadim;Shepherd, Gordon;Sternberg, Paul W.;Martone, Maryann E.
通讯作者：
Martone, Maryann E.
影响因子：
46.9
作者：
Smith, Barry;Ashburner, Michael;Lewis, Suzanna
通讯作者：
Lewis, Suzanna
影响因子：
3
作者：
Turner JA;Laird AR
通讯作者：
Laird AR
影响因子：
3
作者：
Bowden, Douglas M.;Song, Evan;Kosheleva, Julia;Dubach, Mark F.
通讯作者：
Dubach, Mark F.