Single-cell RNA sequencing of mouse brain and lung vascular and vessel-associated cell types.
Single-cell RNA sequencing of mouse brain and lung vascular and vessel-associated cell types.
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DOI：
10.1038/sdata.2018.160
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发表时间：
2018-08-21
期刊：
影响因子：
9.8
通讯作者：
Betsholtz C
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
He L;Vanlandewijck M;Mäe MA;Andrae J;Ando K;Del Gaudio F;Nahar K;Lebouvier T;Laviña B;Gouveia L;Sun Y;Raschperger E;Segerstolpe Å;Liu J;Gustafsson S;Räsänen M;Zarb Y;Mochizuki N;Keller A;Lendahl U;Betsholtz C
血管疾病是导致死亡的主要原因，但我们对血管的细胞成分，包括它们基因表达谱的差异如何创造血管结构和功能的多样性的了解有限。在这篇文章中，我们描述了一个单细胞RNA测序(scRNA-seq)数据集，它定义了小鼠脑和肺中血管和血管相关细胞的类型和亚型。该数据集包含3436个来自小鼠大脑的单细胞转录本，形成了15个与细胞(亚)类型相对应的不同簇，以及另外1,504个来自小鼠肺的单细胞转录本，形成了17个细胞簇。为了方便用户访问我们的数据，我们构建了一个可搜索的数据库(http://betsholtzlab.org/VascularSingleCells/database.html).我们的数据集构成了小鼠脑和肺中血管和血管相关细胞类型的全面分子图谱，因此为未来血管发育和疾病的研究提供了坚实的基础。
Vascular diseases are major causes of death, yet our understanding of the cellular constituents of blood vessels, including how differences in their gene expression profiles create diversity in vascular structure and function, is limited. In this paper, we describe a single-cell RNA sequencing (scRNA-seq) dataset that defines vascular and vessel-associated cell types and subtypes in mouse brain and lung. The dataset contains 3,436 single cell transcriptomes from mouse brain, which formed 15 distinct clusters corresponding to cell (sub)types, and another 1,504 single cell transcriptomes from mouse lung, which formed 17 cell clusters. In order to allow user-friendly access to our data, we constructed a searchable database (http://betsholtzlab.org/VascularSingleCells/database.html). Our dataset constitutes a comprehensive molecular atlas of vascular and vessel-associated cell types in the mouse brain and lung, and as such provides a strong foundation for future studies of vascular development and diseases.
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影响因子：
4.6
作者：
He L;Vanlandewijck M;Raschperger E;Andaloussi Mäe M;Jung B;Lebouvier T;Ando K;Hofmann J;Keller A;Betsholtz C
通讯作者：
Betsholtz C
影响因子：
7
作者：
Picelli S;Björklund AK;Reinius B;Sagasser S;Winberg G;Sandberg R
通讯作者：
Sandberg R
影响因子：
64.5
作者：
Zepp JA;Zacharias WJ;Frank DB;Cavanaugh CA;Zhou S;Morley MP;Morrisey EE
通讯作者：
Morrisey EE
影响因子：
64.8
作者：
Vanlandewijck, Michael;He, Liqun;Betsholtz, Christer
通讯作者：
Betsholtz, Christer
影响因子：
3.7
作者：
Storvall H;Ramsköld D;Sandberg R
通讯作者：
Sandberg R