Aminoglycoside activity observed on single pre-translocation ribosome complexes.
Aminoglycoside activity observed on single pre-translocation ribosome complexes.
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DOI：
10.1038/nchembio.274
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发表时间：
2010-01
影响因子：
14.8
通讯作者：
Blanchard SC
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Feldman MB;Terry DS;Altman RB;Blanchard SC
氨基糖苷类抗生素直接与核糖体 RNA 结合，对核糖体功能产生多效性作用。尽管对氨基糖苷类-RNA寡核苷酸和氨基糖苷类-核糖体相互作用进行了深入的结构研究，但解释化学相似的氨基糖苷类独特核糖体抑制谱的机制仍然难以捉摸。在这里，使用单分子荧光共振能量转移（smFRET）方法，我们证明高亲和力氨基糖苷与功能性预易位核糖体复合物的保守解码位点区域的结合特异性地重塑了颗粒内内在动态过程的性质。这些作用的程度对于氨基糖苷类的每个成员来说都是不同的，与它们对 EF-G 催化易位的抑制密切相关。新霉素是一种 4,5 连接的氨基糖苷，以较低的亲和力与一个或多个二级结合位点结合，介导独特的结构和动态扰动，从而进一步增强易位抑制。这些新见解有助于解释为什么密切相关的氨基糖苷类药物会引发多效性翻译活性，并证明 smFRET 作为剖析抗生素作用机制的工具的潜在效用。
Aminoglycoside-class antibiotics bind directly to ribosomal RNA, imparting pleiotropic effects on ribosome function. Despite in-depth structural investigations of aminoglycoside–RNA oligonucleotide and aminoglycoside-ribosome interactions, mechanisms explaining the unique ribosome inhibition profiles of chemically similar aminoglycosides remain elusive. Here, using single-molecule fluorescence resonance energy transfer (smFRET) methods, we show that high-affinity aminoglycoside binding to the conserved decoding site region of the functional pre-translocation ribosome complex specifically remodels the nature of intrinsic dynamic processes within the particle. The extents of these effects, which are distinct for each member of the aminoglycoside class, strongly correlate with their inhibition of EF-G–catalyzed translocation. Neomycin, a 4,5-linked amino-glycoside, binds with lower affinity to one or more secondary binding sites, mediating distinct structural and dynamic perturbations that further enhance translocation inhibition. These new insights help explain why closely related aminoglycosides elicit pleiotropic translation activities and demonstrate the potential utility of smFRET as a tool for dissecting the mechanisms of antibiotic action.
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影响因子：
2.9
作者：
CAMPUZANO, S;VAZQUEZ, D;MODOLELL, J
通讯作者：
MODOLELL, J
影响因子：
11.4
作者：
Karimi, R;Ehrenberg, M
通讯作者：
Ehrenberg, M
影响因子：
11.4
作者：
Hirokawa, G;Kiel, MC;Kaji, A
通讯作者：
Kaji, A
DOI：
10.1016/0006-291x(78)90178-x
发表时间：
1978-01-01
影响因子：
3.1
作者：
MISUMI, M;NISHIMURA, T;TANAKA, N
通讯作者：
TANAKA, N
影响因子：
5.6
作者：
Jerinic, O;Joseph, S
通讯作者：
Joseph, S