High Fractional Occupancy of a Tandem Maf Recognition Element and Its Role in Long-Range β-Globin Gene Regulation.
High Fractional Occupancy of a Tandem Maf Recognition Element and Its Role in Long-Range β-Globin Gene Regulation.
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串联 Maf 识别元件的高分数占用及其在长程 β-珠蛋白基因调控中的作用。
DOI：
10.1128/mcb.00723-15
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发表时间：
2016
影响因子：
5.3
通讯作者：
Bungert,Jörg
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Stees,JaredR;Hossain,MirA;Sunose,Tomoki;Kudo,Yasushi;Pardo,CarolinaE;Nabilsi,NancyH;Darst,RussellP;Poudyal,Rosha;Igarashi,Kazuhiko;Huang,Suming;Kladde,MichaelP;Bungert,Jörg
增强子和启动子组装蛋白质复合物，最终调节RNA聚合酶的募集和活性。先前的研究表明，至少有一些增强子形成稳定的蛋白质复合物，从而导致增强体的形成。我们使用个体模板甲基转移酶可及性协议（MAPit）分析了小鼠β-珠蛋白基因位点的蛋白质- dna相互作用。这些数据表明，在小鼠红白血病细胞分化过程中，基因座控制区（LCR）超敏位点2 （HS2）的串联Maf识别元件（MARE）显示出非常高的占用度。大多数其他转录因子结合位点在LCR HS2或成人β-珠蛋白基因启动子区域表现出较低的占用率，表明高度动态的蛋白质- dna相互作用。将人造锌指dna结合域（ZF-DBD）靶向HS2串联MARE，导致LCR HS2和成人β主珠蛋白基因启动子上的MARE结合蛋白和转录复合物的关联减少，但不影响β次珠蛋白基因的表达。这些数据表明，在红细胞分化过程中，LCR HS2中稳定的mare相关足迹对于转录复合物募集到成人β主珠蛋白基因启动子是重要的。
Enhancers and promoters assemble protein complexes that ultimately regulate the recruitment and activity of RNA polymerases. Previous work has shown that at least some enhancers form stable protein complexes, leading to the formation of enhanceosomes. We analyzed protein-DNA interactions in the murine β-globin gene locus using the methyltransferase accessibility protocol for individual templates (MAPit). The data show that a tandem Maf recognition element (MARE) in locus control region (LCR) hypersensitive site 2 (HS2) reveals a remarkably high degree of occupancy during differentiation of mouse erythroleukemia cells. Most of the other transcription factor binding sites in LCR HS2 or in the adult β-globin gene promoter regions exhibit low fractional occupancy, suggesting highly dynamic protein-DNA interactions. Targeting of an artificial zinc finger DNA-binding domain (ZF-DBD) to the HS2 tandem MARE caused a reduction in the association of MARE-binding proteins and transcription complexes at LCR HS2 and the adult βmajor-globin gene promoter but did not affect expression of the βminor-globin gene. The data demonstrate that a stable MARE-associated footprint in LCR HS2 is important for the recruitment of transcription complexes to the adult βmajor-globin gene promoter during erythroid cell differentiation.
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