The complete chloroplast genome sequence of Vitis champinii.
The complete chloroplast genome sequence of Vitis champinii.
复制标题
香皮葡萄叶绿体基因组全序列
DOI：
10.1080/23802359.2020.1791005
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发表时间：
2020-07-15
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Wu J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Xiang J;Wei L;Cheng J;Li M;Cui P;Wu J
摘要 Vitis champinii 是一种葡萄树砧木物种，广泛应用于葡萄园以及线虫种群较多或盐渍土地区的砧木育种项目。在这里，报道了 V. champinii 的完整叶绿体基因组。叶绿体基因组的长度为160,657bp，其中一个大单拷贝区域为89,217bp，一个小单拷贝区域为19,504bp，两个独立的反向区域分别为51,936bp。该基因组总共鉴定出 130 个独特基因，其中包括 85 个蛋白质编码基因、37 个 tRNA 基因和 8 个 rRNA 基因。系统发育分析表明V. champinii 与Vitis acerifolia 密切相关。
Abstract Vitis champinii is a grapevine rootstock species and widely used in vineyards and in rootstock breeding programs for regions with high nematode populations or saline soils. Here, the complete chloroplast genome of V. champinii was reported. The length of the chloroplast genome was 160,657 bp with a large single copy region of 89,217 bp, a small single copy region of 19,504 bp and two separated inverted regions of 51,936 bp, respectively. In total, 130 unique genes were identified of this genome, including 85 protein-coding genes, 37 tRNA genes, and 8 rRNA genes. Phylogenetic analysis indicates that V. champinii is closely related to Vitis acerifolia.
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Tillich M;Lehwark P;Pellizzer T;Ulbricht-Jones ES;Fischer A;Bock R;Greiner S
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DOI：
10.21273/jashs.121.6.1020
发表时间：
1996-11-01
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Qu, XP;Lu, J;Lamikanra, O
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