EMU: reconfigurable graphical user interfaces for Micro-Manager.
EMU: reconfigurable graphical user interfaces for Micro-Manager.
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DOI：
10.1186/s12859-020-03727-8
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发表时间：
2020-10-15
影响因子：
3
通讯作者：
Ries J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Deschamps J;Ries J
先进的光学显微镜方法是许多生物学研究的关键。除了实验方面，它们的易用性还取决于直观的图形用户界面（GUI）。开源软件Micro-Manager为显微镜控制提供了一个通用的GUI，但需要实现插件来进一步定制特定的系统。然而，gui通常是为单个系统量身定制的。由于即使是类似的设备也可能具有不同的Micro-Manager设备属性，例如功率百分比与绝对功率，因此直接将GUI转移到另一个设备通常需要更改源代码。我们开发了更容易的微管理器用户界面（EMU），一个微管理器插件，以简化构建灵活和可重构的gui。EMU可以与Java Swing库无缝地使用，为Micro-Manager创建与设备无关的gui。这样的GUI很容易转移到另一个显微镜，这要归功于一个直观的配置菜单，包括设备属性到GUI功能的映射和图形元素的自定义。我们还提供了用户和编程指南、教程和代码示例等资源。Micro-Manager用户现在有一个强大的工具来改善他们的仪器的用户体验。EMU图形用户界面可以很容易地配置为新的显微镜，并与其他研究小组共享。未来，新开发的gui将被添加到EMU中，以使整个社区受益。
Advanced light microscopy methods are key to many biological studies. Their ease of use depends, besides experimental aspects, on intuitive graphical user interfaces (GUI). The open-source software Micro-Manager offers a universal GUI for microscope control but requires implementing plugins to further tailor it to specific systems. However, GUIs are often tailored to a single system. Since even similar devices can have different Micro-Manager device properties, such as power percentage versus absolute power, directly transferring a GUI to another instrument usually requires changing the source-code. We developed Easier Micro-Manager User interface (EMU), a Micro-Manager plugin, to simplify building flexible and reconfigurable GUIs. EMU can be seamlessly used with the Java Swing library to create device-independent GUIs for Micro-Manager. Such GUIs are easily transferred to another microscope thanks to an intuitive configuration menu that includes mapping of the device properties to the GUI functionalities and customization of the graphical elements. We also provide resources such as user and programming guides, a tutorial and code examples. Micro-Manager users now have a powerful tool to improve the user experience on their instruments. EMU GUIs can be easily configured for new microscopes and shared with other research groups. In the future, newly developed GUIs will be added to EMU to benefit the whole community.
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