ProTherm and ProNIT: thermodynamic databases for proteins and protein-nucleic acid interactions.

ProTherm and ProNIT: thermodynamic databases for proteins and protein-nucleic acid interactions.
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DOI:
10.1093/nar/gkj103
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发表时间:
2006-01-01
影响因子:
14.9
通讯作者:
Sarai A
Sarai A
中科院分区:
生物学2区
文献类型:
--
作者:
Kumar MD;Bava KA;Gromiha MM;Prabakaran P;Kitajima K;Uedaira H;Sarai A

文献摘要

参考文献

被引文献

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ProTherm 和 ProNIT 是两个热力学数据库,分别包含通过实验确定的蛋白质稳定性和蛋白质-核酸相互作用的热力学参数。两个数据库的当前版本都大大增加了条目总数,并通过添加新字段、改进的搜索、显示和排序选项增强了搜索界面。截至 2005 年 9 月,ProTherm 5.0 版本包含来自 771 种蛋白质的 17 113 条条目,这些条目取自 1497 篇科学文章(与之前版本相比,数据增加了约 20%)。 ProNIT 2.0 版包含来自 273 篇研究文章的 4900 个条目,代表 158 种蛋白质。这两个数据库都可以使用 WWW 界面进行查询。该网页提供快速搜索和高级搜索,以便于轻松检索和显示这些数据库中的数据。 ProTherm 可免费在线获取,ProNIT 可免费在线获取。
ProTherm and ProNIT are two thermodynamic databases that contain experimentally determined thermodynamic parameters of protein stability and protein–nucleic acid interactions, respectively. The current versions of both the databases have considerably increased the total number of entries and enhanced search interface with added new fields, improved search, display and sorting options. As on September 2005, ProTherm release 5.0 contains 17 113 entries from 771 proteins, retrieved from 1497 scientific articles (∼20% increase in data from the previous version). ProNIT release 2.0 contains 4900 entries from 273 research articles, representing 158 proteins. Both databases can be queried using WWW interfaces. Both quick search and advanced search are provided on this web page to facilitate easy retrieval and display of the data from these databases. ProTherm is freely available online at and ProNIT at .
DOI: 10.1093/nar/gki397
发表时间: 2005-07-01
影响因子: 14.9
作者:
Neshich, G;Borro, LC;Higa, RH;Kuser, PR;Yamagishi, MEB;Franco, EH;Krauchenco, JN;Fileto, R;Ribeiro, AA;Bezerra, GBP;Velludo, TM;Jimenez, TS;Furukawa, N;Teshima, H;Kitajima, K;Bava, A;Sarai, A;Togawa, RC;Mancini, AL
通讯作者: Mancini, AL
DOI: 10.1093/bioinformatics/14.2.188
发表时间: 1998-01-01
期刊: BIOINFORMATICS
影响因子: 5.8
作者:
An, JH;Nakama, T;Sarai, A
通讯作者: Sarai, A
DOI: 10.1107/s0907444998007926
发表时间: 1998-11-01
期刊: ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY
影响因子: --
作者:
Berman, HM;Zardecki, C;Westbrook, J
通讯作者: Westbrook, J
DOI: 10.1093/nar/gkg095
发表时间: 2003-01-01
影响因子: 14.9
作者:
Boeckmann, B;Bairoch, A;Schneider, M
通讯作者: Schneider, M
DOI: 10.1093/nar/27.1.286
发表时间: 1999-01-01
影响因子: 14.9
作者:
Gromiha, MM;An, J;Sarai, A
通讯作者: Sarai, A