Structural basis for ribosome recycling by RRF and tRNA.
Structural basis for ribosome recycling by RRF and tRNA.
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RRF 和 tRNA 回收核糖体的结构基础
DOI：
10.1038/s41594-019-0350-7
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发表时间：
2020-01
影响因子：
16.8
通讯作者：
Gagnon, Matthieu G.
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhou, Dejian;Tanzawa, Takehito;Lin, Jinzhong;Gagnon, Matthieu G.
细菌核糖体通过两种保守蛋白质——延伸因子G（EF - G）和核糖体循环因子（RRF）被循环为亚基。RRF和EF - G进行核糖体循环的分子基础仍不清楚。在此，我们报道了分辨率为3.5 Å的终止后嗜热栖热菌70S核糖体与EF - G、RRF以及两种tRNA形成的复合物的晶体结构。P位点的去酰化tRNA移动到一种之前未被发现的结合状态（肽酰/循环；p/R），该状态类似于起始过程中所观察到的状态。p/R - tRNA的末端与50S亚基形成不利的接触，同时RRF楔入中央亚基间桥附近，这阐明了tRNA和RRF在核糖体亚基解离中的积极作用。该结构揭示了tRNA在P位点和E位点之间转移时缺失的一个瞬间状态，为核糖体循环和tRNA易位的机制提供了见解。
The bacterial ribosome is recycled into subunits by two conserved proteins, elongation factor G (EF-G) and the ribosome recycling factor (RRF). The molecular basis for ribosome recycling by RRF and EF-G remains unclear. Here, we report the crystal structure of a postterminationThermus thermophilus70S ribosome complexed with EF-G, RRF and two transfer RNAs at a resolution of 3.5 Å. The deacylated tRNA in the peptidyl (P) site moves into a previously unsuspected state of binding (peptidyl/recycling, p/R) that is analogous to that seen during initiation. The terminal end of the p/R-tRNA forms nonfavorable contacts with the 50S subunit while RRF wedges next to central inter-subunit bridges, illuminating the active roles of tRNA and RRF in dissociation of ribosomal subunits. The structure uncovers a missing snapshot of tRNA as it transits between the P and exit (E) sites, providing insights into the mechanisms of ribosome recycling and tRNA translocation.
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DOI：
10.1126/science.1240585
发表时间：
2013-11-15
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Fernández IS;Bai XC;Hussain T;Kelley AC;Lorsch JR;Ramakrishnan V;Scheres SHW
通讯作者：
Scheres SHW
DOI：
10.1107/s0907444904019158
发表时间：
2004-12-01
影响因子：
2.2
作者：
Emsley, P;Cowtan, K
通讯作者：
Cowtan, K
DOI：
10.1126/science.1202692
发表时间：
2011-05-20
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Dunkle JA;Wang L;Feldman MB;Pulk A;Chen VB;Kapral GJ;Noeske J;Richardson JS;Blanchard SC;Cate JH
通讯作者：
Cate JH
DOI：
10.1126/science.1179709
发表时间：
2009-10-30
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Gao YG;Selmer M;Dunham CM;Weixlbaumer A;Kelley AC;Ramakrishnan V
通讯作者：
Ramakrishnan V
DOI：
10.1107/s0907444902016657
发表时间：
2002-11-01
影响因子：
2.2
作者：
Adams, PD;Grosse-Kunstleve, RW;Terwilliger, TC
通讯作者：
Terwilliger, TC