ColabFold: making protein folding accessible to all.
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DOI：
10.1038/s41592-022-01488-1
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发表时间：
2022-06
期刊：
影响因子：
48
通讯作者：
Steinegger, Martin
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Mirdita, Milot;Schutze, Konstantin;Moriwaki, Yoshitaka;Heo, Lim;Ovchinnikov, Sergey;Steinegger, Martin
ColabFold通过将MMseqs 2与AlphaFold 2或RoseTTAFold的快速同源性搜索相结合，提供了对蛋白质结构和复合物的加速预测。ColabFold的搜索速度提高了40 - 60倍，优化了模型利用率，在一台带有图形处理单元的服务器上，每天可以预测近1,000个结构。与Google Colaboratory相结合，ColabFold成为一个免费的蛋白质折叠平台。ColabFold是一个开源软件，可在https://github.com/sokrypton/ColabFold上获得，其新颖的环境数据库可在www.example.com上获得。https://colabfold.mmseqs.com ColabFold是一个免费且可访问的蛋白质折叠平台，可使用AlphaFold 2或RoseTTAFold加速蛋白质结构和复合物的预测。
ColabFold offers accelerated prediction of protein structures and complexes by combining the fast homology search of MMseqs2 with AlphaFold2 or RoseTTAFold. ColabFold’s 40−60-fold faster search and optimized model utilization enables prediction of close to 1,000 structures per day on a server with one graphics processing unit. Coupled with Google Colaboratory, ColabFold becomes a free and accessible platform for protein folding. ColabFold is open-source software available at https://github.com/sokrypton/ColabFold and its novel environmental databases are available at https://colabfold.mmseqs.com. ColabFold is a free and accessible platform for protein folding that provides accelerated prediction of protein structures and complexes using AlphaFold2 or RoseTTAFold.
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影响因子：
14.9
作者：
Mistry J;Chuguransky S;Williams L;Qureshi M;Salazar GA;Sonnhammer ELL;Tosatto SCE;Paladin L;Raj S;Richardson LJ;Finn RD;Bateman A
通讯作者：
Bateman A
影响因子：
16.6
作者：
Bryant P;Pozzati G;Elofsson A
通讯作者：
Elofsson A
DOI：
10.1016/j.xgen.2022.100123
发表时间：
2022-05-11
期刊：
CELL GENOMICS
影响因子：
--
作者：
Delmont, Tom O.;Gaia, Morgan;Hinsinger, Damien D.;Fremont, Paul;Vanni, Chiara;Fernandez-Guerra, Antonio;Eren, A. Murat;Kourlaiev, Artem;d'Agata, Leo;Clayssen, Quentin;Villar, Emilie;Labadie, Karine;Cruaud, Corinne;Poulain, Julie;Da Silva, Corinne;Wessner, Marc;Noel, Benjamin;Aury, Jean-Marc;de Vargas, Colomban;Bowler, Chris;Karsenti, Eric;Pelletier, Eric;Wincker, Patrick;Jaillon, Olivier
通讯作者：
Jaillon, Olivier
影响因子：
14.8
作者：
Kozakov D;Hall DR;Xia B;Porter KA;Padhorny D;Yueh C;Beglov D;Vajda S
通讯作者：
Vajda S
影响因子：
2.9
作者：
Krivov, Georgii G.;Shapovalov, Maxim V.;Dunbrack, Roland L., Jr.
通讯作者：
Dunbrack, Roland L., Jr.