Diet dominates host genotype in shaping the murine gut microbiota.
Diet dominates host genotype in shaping the murine gut microbiota.
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DOI：
10.1016/j.chom.2014.11.010
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发表时间：
2015-01-14
影响因子：
30.3
通讯作者：
Turnbaugh PJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Carmody RN;Gerber GK;Luevano JM Jr;Gatti DM;Somes L;Svenson KL;Turnbaugh PJ
哺乳动物的肠道微生物群表现出明显的个体间差异，但目前尚不清楚这主要是由宿主遗传学还是饮食摄入等外在因素驱动的。为了解决这个问题，我们研究了饮食扰动对五种近交系小鼠、缺乏与宿主微生物相互作用相关基因的小鼠（MyD88−/−、NOD2−/−、ob/ob 和 Rag1−/−）以及超过 200 只远交小鼠的肠道微生物群的影响。在每个实验中，尽管宿主基因型存在差异，但高脂肪、高糖饮食的摄入可重复地改变肠道微生物群。肠道微生物群对饮食扰动表现出线性剂量反应，每个饮食响应细菌群平均需要 3.5 天才能达到新的稳定状态。反复的饮食改变表明，肠道微生物群的大多数变化都是可逆的，同时也发现了细菌的丰度取决于之前的摄入量。这些结果强调了饮食在塑造宿主相关微生物群落的个体间差异方面发挥的主导作用。
Mammals exhibit marked inter-individual variations in their gut microbiota, but it remains unclear if this is primarily driven by host genetics or by extrinsic factors like dietary intake. To address this, we examined the effect of dietary perturbations on the gut microbiota of five inbred mouse strains, mice deficient for genes relevant to host-microbial interactions (MyD88−/−, NOD2−/−, ob/ob, and Rag1−/−), and >200 outbred mice. In each experiment, consumption of a high-fat, high-sugar diet reproducibly altered the gut microbiota despite differences in host genotype. The gut microbiota exhibited a linear dose response to dietary perturbations, taking an average of 3.5 days for each diet-responsive bacterial groups to reach a new steady state. Repeated dietary shifts demonstrated that most changes to the gut microbiota are reversible, while also uncovering bacteria whose abundance depends on prior consumption. These results emphasize the dominant role that diet plays in shaping inter-individual variations in host-associated microbial communities.
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影响因子：
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作者：
Hashimoto T;Perlot T;Rehman A;Trichereau J;Ishiguro H;Paolino M;Sigl V;Hanada T;Hanada R;Lipinski S;Wild B;Camargo SM;Singer D;Richter A;Kuba K;Fukamizu A;Schreiber S;Clevers H;Verrey F;Rosenstiel P;Penninger JM
通讯作者：
Penninger JM
影响因子：
2.5
作者：
Churchill, Gary A.;Gatti, Daniel M.;Munger, Steven C.;Svenson, Karen L.
通讯作者：
Svenson, Karen L.
DOI：
10.1126/science.1224203
发表时间：
2012-06-08
期刊：
Science (New York, N.Y.)
影响因子：
--
作者：
Costello EK;Stagaman K;Dethlefsen L;Bohannan BJ;Relman DA
通讯作者：
Relman DA
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作者：
Maurice CF;Haiser HJ;Turnbaugh PJ
通讯作者：
Turnbaugh PJ
DOI：
10.1126/science.1198719
发表时间：
2011-05-20
期刊：
Science (New York, N.Y.)
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Muegge BD;Kuczynski J;Knights D;Clemente JC;González A;Fontana L;Henrissat B;Knight R;Gordon JI
通讯作者：
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