Diet drives convergence in gut microbiome functions across mammalian phylogeny and within humans.
Diet drives convergence in gut microbiome functions across mammalian phylogeny and within humans.
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DOI：
10.1126/science.1198719
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发表时间：
2011-05-20
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Gordon JI
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Muegge BD;Kuczynski J;Knights D;Clemente JC;González A;Fontana L;Henrissat B;Knight R;Gordon JI
哺乳动物及其肠道微生物群的共同进化深刻地影响了它们对无数栖息地的辐射。我们使用了微生物群落DNA的鸟枪测序和细菌16S rRNA基因的靶向测序，以了解微生物群落如何适应极端的饮食，从33种哺乳动物和18名保持详细饮食记录的人的粪便DNA中取样。我们发现，微生物群对饮食的适应在不同的哺乳动物谱系中是可重复的。微生物组基因的功能库，如编码碳水化合物活性酶和蛋白酶的基因，可以从细菌物种组合中预测。这些结果说明了表征脊椎动物肠道微生物组的价值，以充分了解宿主在超生物体水平上的进化历史。
Co-evolution of mammals and their gut microbiota has profoundly effected their radiation into myriad habitats. We used shotgun sequencing of microbial community DNA and targeted sequencing of bacterial 16S rRNA genes to understand how microbial communities adapt to extremes of diets, sampling fecal DNAs from 33 mammalian species and 18 humans who kept detailed diet records. We found that microbiota adaptation to diet is reproducible across different mammalian lineages. Functional repertoires of microbiome genes, such as those encoding carbohydrate-active enzymes and proteases, can be predicted from bacterial species assemblages. These results illustrate the value of characterizing vertebrate gut microbiomes to fully understand host evolutionary histories at a supra-organismal level.
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