The Transcriptional Network in the Arabidopsis Circadian Clock System.
The Transcriptional Network in the Arabidopsis Circadian Clock System.
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DOI：
10.3390/genes11111284
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发表时间：
2020-10-29
期刊：
影响因子：
3.5
通讯作者：
Nakamichi N
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Nakamichi N
生物钟是一种生物计时系统，它控制着大多数生物体中遗传、代谢、生理和行为过程的大约24小时节律。这种振荡使生物体能够预测和适应环境的昼夜变化。分子生物学研究表明，转录-翻译反馈环（TTFL）是拟南芥（Arabidopsis thaliana，Arabidopsis）生物钟功能的重要组成部分。使用下一代测序仪的组学研究进一步揭示了TTFL中的转录因子直接调节与时钟输出途径有关的关键基因。本文对拟南芥生物钟相关转录因子的靶基因进行了综述。拟南芥时钟转录网络在被子植物中部分保守。此外，时钟依赖的转录网络结构的背景下，适应昼夜循环的植物行为进行了讨论。
The circadian clock is the biological timekeeping system that governs the approximately 24-h rhythms of genetic, metabolic, physiological and behavioral processes in most organisms. This oscillation allows organisms to anticipate and adapt to day–night changes in the environment. Molecular studies have indicated that a transcription–translation feedback loop (TTFL), consisting of transcriptional repressors and activators, is essential for clock function in Arabidopsis thaliana (Arabidopsis). Omics studies using next-generation sequencers have further revealed that transcription factors in the TTFL directly regulate key genes implicated in clock-output pathways. In this review, the target genes of the Arabidopsis clock-associated transcription factors are summarized. The Arabidopsis clock transcriptional network is partly conserved among angiosperms. In addition, the clock-dependent transcriptional network structure is discussed in the context of plant behaviors for adapting to day–night cycles.
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影响因子：
18
作者：
Ezer D;Jung JH;Lan H;Biswas S;Gregoire L;Box MS;Charoensawan V;Cortijo S;Lai X;Stöckle D;Zubieta C;Jaeger KE;Wigge PA
通讯作者：
Wigge PA
影响因子：
7.4
作者：
Green, RM;Tingay, S;Tobin, EM
通讯作者：
Tobin, EM
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作者：
Cha JY;Kim J;Kim TS;Zeng Q;Wang L;Lee SY;Kim WY;Somers DE
通讯作者：
Somers DE
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作者：
Endo, Motomu;Shimizu, Hanako;Nohales, Maria A.;Araki, Takashi;Kay, Steve A.
通讯作者：
Kay, Steve A.
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作者：
Fowler, SG;Cook, D;Thomashow, ME
通讯作者：
Thomashow, ME