PINT: Protein-protein Interactions Thermodynamic Database.
PINT: Protein-protein Interactions Thermodynamic Database.
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DOI：
10.1093/nar/gkj017
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发表时间：
2006-01-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Gromiha MM
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Kumar MD;Gromiha MM
蛋白质相互作用热力学数据库（PINT）的第一个版本包含了超过1500个热力学参数的数据，沿着序列和结构信息，实验条件和文献信息。每个条目包含相互作用蛋白质结合时的自由能变化、解离常数、缔合常数、焓变、热容变化等数值数据，这些数据对于理解蛋白质-蛋白质相互作用的机制非常重要。PINT还包括参与结合的蛋白质的名称和来源，其蛋白质信息资源，SWISS-PROT和蛋白质数据库（PDB）代码，突变位置残基的二级结构和溶剂可及性，测量方法，实验条件，如缓冲液，离子和添加剂，以及文献信息。WWW界面方便用户根据各种条件搜索数据，选择输出术语的可行性和不同的排序选项。此外，PINT与其他相关数据库，PIR，SWISS-PROT，PDB和NCBI PUBMED文献数据库交联。该数据库可在
The first release of Protein–protein Interactions Thermodynamic Database (PINT) contains >1500 data of several thermodynamic parameters along with sequence and structural information, experimental conditions and literature information. Each entry contains numerical data for the free energy change, dissociation constant, association constant, enthalpy change, heat capacity change and so on of the interacting proteins upon binding, which are important for understanding the mechanism of protein–protein interactions. PINT also includes the name and source of the proteins involved in binding, their Protein Information Resource, SWISS-PROT and Protein Data Bank (PDB) codes, secondary structure and solvent accessibility of residues at mutant positions, measuring methods, experimental conditions, such as buffers, ions and additives, and literature information. A WWW interface facilitates users to search data based on various conditions, feasibility to select the terms for output and different sorting options. Further, PINT is cross-linked with other related databases, PIR, SWISS-PROT, PDB and NCBI PUBMED literature database. The database is freely available at
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