(Differentially) Expressed tRNA-Derived Small RNAs Co-Sediment Primarily with Non-Polysomal Fractions in Drosophila.
(Differentially) Expressed tRNA-Derived Small RNAs Co-Sediment Primarily with Non-Polysomal Fractions in Drosophila.
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DOI：
10.3390/genes8110333
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发表时间：
2017-11-20
期刊：
影响因子：
3.5
通讯作者：
Akgül B
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Göktaş Ç;Yiğit H;Coşacak Mİ;Akgül B
最近的研究指出，存在由mRNAs、rRNAs和tRNAs产生的特性不佳的小调节RNAs。为了探索tRNA来源的小RNA的亚细胞定位，对0-1和7-8h的果蝇胚胎在蔗糖密度梯度上进行了分级。对未分离和分离的果蝇胚胎的12,553,921个深度测序读数的分析表明，主要从tRNAs的5‘端检测到的TRFs与非多聚体部分共沉淀。有趣的是，在胚胎从母体到受精卵的转变过程中，TRFs的一个子集的表达水平会发生时间上的变化。我们还在S2细胞中检测到TRFs的非多聚体关联。不同的TRF表达模式在生物体水平上具有发育意义。这些结果表明，TRFs主要与果蝇胚胎和S2细胞中的非多聚体复合体有关。
Recent studies point to the existence of poorly characterized small regulatory RNAs generated from mRNAs, rRNAs and tRNAs. To explore the subcellular location of tRNA-derived small RNAs, 0–1 and 7–8 h Drosophila embryos were fractionated on sucrose density gradients. Analysis of 12,553,921 deep-sequencing reads from unfractionated and fractionated Drosophila embryos has revealed that tRFs, which are detected mainly from the 5’ends of tRNAs, co-sediment with the non-polysomal fractions. Interestingly, the expression levels of a subset of tRFs change temporally following the maternal-to-zygotic transition in embryos. We detected non-polysomal association of tRFs in S2 cells as well. Differential tRF expression pattern points to developmental significance at the organismal level. These results suggest that tRFs are associated primarily with the non-polysomal complexes in Drosophila embryos and S2 cells.
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影响因子：
3.7
作者：
Liao JY;Ma LM;Guo YH;Zhang YC;Zhou H;Shao P;Chen YQ;Qu LH
通讯作者：
Qu LH
DOI：
10.1590/s0074-02762012000600018
发表时间：
2012-09-01
期刊：
Memórias do Instituto Oswaldo Cruz
影响因子：
--
作者：
Reifur, Larissa;Garcia-Silva, Maria Rosa;Dallagiovanna, Bruno
通讯作者：
Dallagiovanna, Bruno
应激诱导的 tRNA 衍生 RNA：原始真核生物兰氏贾第鞭毛虫中的一类新型小 RNA。
影响因子：
14.9
作者：
Li Y;Luo J;Zhou H;Liao JY;Ma LM;Chen YQ;Qu LH
通讯作者：
Qu LH
DOI：
10.3390/life5041638
发表时间：
2015-11-27
期刊：
Life (Basel, Switzerland)
影响因子：
--
作者：
Keam SP;Hutvagner G
通讯作者：
Hutvagner G
DOI：
10.1073/pnas.0911561107
发表时间：
2010-06-22
影响因子：
11.1
作者：
Kamhi, Eyal;Raitskin, Oleg;Sperling, Joseph
通讯作者：
Sperling, Joseph