The Comparative Toxicogenomics Database: update 2011.
The Comparative Toxicogenomics Database: update 2011.
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DOI：
10.1093/nar/gkq813
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发表时间：
2011-01
影响因子：
14.9
通讯作者：
Mattingly CJ
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Davis AP;King BL;Mockus S;Murphy CG;Saraceni-Richards C;Rosenstein M;Wiegers T;Mattingly CJ
比较毒物基因组学数据库（CTD）是一个公共资源，旨在促进对环境化学品与基因产物的相互作用及其对人类健康的影响的了解。CTD的生物馆长从文献中手动整理化学-基因、化学-疾病和基因-疾病的关系。然后将这些核心数据整合起来构建化学-基因-疾病网络，并使用不同类型的相关数据预测许多新的关系。自2009年以来，我们将CTD的内容大幅增加到140万化学-基因-疾病数据点，并增加了许多功能，统计分析和分析工具，包括GeneComps和ChemComps（查找具有相同毒性基因组图谱的可比基因和化学品），丰富了与化学品相关的基因本体术语，对化学-疾病推断进行统计排序，发现任何一组化学品，基因或疾病的重叠和独特属性的维恩图工具。以及增强的基因通路数据内容等。总之，这些丰富的化学-基因-疾病数据继续帮助用户产生关于环境疾病分子机制的可测试假设。CTD可在http://ctd.mdibl.org免费获得。
The Comparative Toxicogenomics Database (CTD) is a public resource that promotes understanding about the interaction of environmental chemicals with gene products, and their effects on human health. Biocurators at CTD manually curate a triad of chemical–gene, chemical–disease and gene–disease relationships from the literature. These core data are then integrated to construct chemical–gene–disease networks and to predict many novel relationships using different types of associated data. Since 2009, we dramatically increased the content of CTD to 1.4 million chemical–gene–disease data points and added many features, statistical analyses and analytical tools, including GeneComps and ChemComps (to find comparable genes and chemicals that share toxicogenomic profiles), enriched Gene Ontology terms associated with chemicals, statistically ranked chemical–disease inferences, Venn diagram tools to discover overlapping and unique attributes of any set of chemicals, genes or disease, and enhanced gene pathway data content, among other features. Together, this wealth of expanded chemical–gene–disease data continues to help users generate testable hypotheses about the molecular mechanisms of environmental diseases. CTD is freely available at http://ctd.mdibl.org.
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影响因子：
14.9
作者：
Davis AP;Murphy CG;Saraceni-Richards CA;Rosenstein MC;Wiegers TC;Mattingly CJ
通讯作者：
Mattingly CJ
影响因子：
3
作者：
Chen B;Dong X;Jiao D;Wang H;Zhu Q;Ding Y;Wild DJ
通讯作者：
Wild DJ
影响因子：
14.9
作者：
Kanehisa M;Araki M;Goto S;Hattori M;Hirakawa M;Itoh M;Katayama T;Kawashima S;Okuda S;Tokimatsu T;Yamanishi Y
通讯作者：
Yamanishi Y
影响因子：
14.9
作者：
Lim E;Pon A;Djoumbou Y;Knox C;Shrivastava S;Guo AC;Neveu V;Wishart DS
通讯作者：
Wishart DS
影响因子：
--
作者：
Tomasulo, Patricia
通讯作者：
Tomasulo, Patricia