Data for iTRAQ-based quantitative proteomics analysis of different biotypes in Echinochloa crus-galli with multi-herbicide treatment.
Data for iTRAQ-based quantitative proteomics analysis of different biotypes in Echinochloa crus-galli with multi-herbicide treatment.
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基于 iTRAQ 的多重除草剂处理稗草不同生物型的定量蛋白质组学分析数据
DOI：
10.1016/j.dib.2016.10.017
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发表时间：
2016-12
期刊：
影响因子：
1.2
通讯作者：
Li, Yongfeng
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Yang, Xia;Zhang, Zichang;Gu, Tao;Dong, Mingchao;Peng, Qiong;Bai, Lianyang;Li, Yongfeng
稗草（Echinochloa crus-galli）是世界上最难对付的抗除草剂杂草之一，其干扰水稻生长和产量。在这里，我们提供的数据，从比较蛋白质组学分析的叶片在抗性（R）和敏感（S）生物型的稗草都有和没有多除草剂处理在两个独立的生物实验，使用iTRAQ。给出了多肽长度和数量的分布、蛋白质的质量和序列覆盖率，并分析了重复性。通过对uniprot数据库的检索和数据分析，从2248个独特肽中鉴定出1342个差异积累蛋白。这些结果与研究文章“定量蛋白质组学揭示了多除草剂抗性稗草（Echinochloa crus-galli L.）“（X.杨，Z. Zhang，T.顾，M.东角，澳-地彭湖，澳-地Bai，Y Li，2017）。
Barnyardgrass (Echinochloa crus-galli) is one of the most troublesome herbicide-resistant weeds worldwide that interferes with rice growth and rice yield. Here we provide the data from a comparative proteomic analysis of leaves in resistant (R) and susceptible (S) biotypes of Echinochloa crus-galli both with and without multi-herbicide treatment in two independent biological experiments using iTRAQ. The distribution of length and number of peptides, mass and sequence coverage of proteins were presented, and the repeatability of the replicates was analyzed. 1342 differential accumulated proteins were identified from 2248 unique peptides by searching uniprot database and data analysis. These results are associated with the research article "Quantitative proteomics reveals ecological fitness cost of multi-herbicide resistant barnyardgrass (Echinochloa crus-galli L.)" (X. Yang, Z. Zhang, T. Gu, M. Dong, Q. Peng, L. Bai, Y Li, 2017).
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