R3D Align web server for global nucleotide to nucleotide alignments of RNA 3D structures.
R3D Align web server for global nucleotide to nucleotide alignments of RNA 3D structures.
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DOI：
10.1093/nar/gkt417
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发表时间：
2013-07
影响因子：
14.9
通讯作者：
Zirbel CL
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Rahrig RR;Petrov AI;Leontis NB;Zirbel CL
R3D Align web服务器提供“RNA 3D Align”（R3D Align）的在线访问，这是一种生成RNA 3D结构的精确核苷酸级结构比对的方法。web服务器提供了一个流线型和直观的界面，输入数据验证和输出比相关服务器更广泛，更容易阅读和解释。R3D Align web服务器提供了一个独特的特色对齐库，提供了对大型RNA 3D结构（包括所有核糖体RNA）预先计算的对齐的即时访问，以及对有效使用服务器和输出解释的指导。通过访问鲍灵格林州立大学RNA组提供的RNA 3D结构的非冗余列表，R3D Align将用户连接到相同等价类中的结构文件和来自每个组的最佳建模代表性结构。R3D Align web服务器可以在http://rna.bgsu.edu/r3dalign/免费访问。
The R3D Align web server provides online access to ‘RNA 3D Align’ (R3D Align), a method for producing accurate nucleotide-level structural alignments of RNA 3D structures. The web server provides a streamlined and intuitive interface, input data validation and output that is more extensive and easier to read and interpret than related servers. The R3D Align web server offers a unique Gallery of Featured Alignments, providing immediate access to pre-computed alignments of large RNA 3D structures, including all ribosomal RNAs, as well as guidance on effective use of the server and interpretation of the output. By accessing the non-redundant lists of RNA 3D structures provided by the Bowling Green State University RNA group, R3D Align connects users to structure files in the same equivalence class and the best-modeled representative structure from each group. The R3D Align web server is freely accessible at http://rna.bgsu.edu/r3dalign/.
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