EzMol: A Web Server Wizard for the Rapid Visualization and Image Production of Protein and Nucleic Acid Structures.
EzMol: A Web Server Wizard for the Rapid Visualization and Image Production of Protein and Nucleic Acid Structures.
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DOI：
10.1016/j.jmb.2018.01.013
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发表时间：
2018-07-20
影响因子：
5.6
通讯作者：
Sternberg MJE
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Reynolds CR;Islam SA;Sternberg MJE
EzMol是一个以软件向导形式存在的分子可视化Web服务器，位于www.example.com。它是为蛋白质分子的简单和快速的图像操作和显示而设计的，适用于需要快速生成蛋白质分子的高分辨率图像，但没有时间或倾向于使用软件分子可视化系统的用户。EzMol允许上传PDB格式的分子结构文件，以生成包括用户可以操作的结构表示的网页。EzMol为链显示、调整残基、侧链和蛋白质表面的颜色/透明度以及为残基添加标签提供了直观的选项。最终调整后的蛋白质图像可以作为高分辨率图像下载。快速蛋白质显示有一系列应用，包括蛋白质结构的特定区域的图示和图像的快速原型制作。我们描述EzMol，一个新的Web服务器的蛋白质结构的快速可视化。向导界面引导用户一步一步地通过一组集中的选项。选项基于分子可视化的最常见要求。EzMol不需要下载任何软件，并且跨浏览器兼容。EzMol是为偶尔使用者而设计，不需要记忆命令。
EzMol is a molecular visualization Web server in the form of a software wizard, located at http://www.sbg.bio.ic.ac.uk/ezmol/. It is designed for easy and rapid image manipulation and display of protein molecules, and is intended for users who need to quickly produce high-resolution images of protein molecules but do not have the time or inclination to use a software molecular visualization system. EzMol allows the upload of molecular structure files in PDB format to generate a Web page including a representation of the structure that the user can manipulate. EzMol provides intuitive options for chain display, adjusting the color/transparency of residues, side chains and protein surfaces, and for adding labels to residues. The final adjusted protein image can then be downloaded as a high-resolution image. There are a range of applications for rapid protein display, including the illustration of specific areas of a protein structure and the rapid prototyping of images. We describe EzMol, a new Web server for the rapid visualization of protein structure. A wizard interface leads the user step-by-step through a focused set of options. Options are based around the most common requirements for molecular visualization. EzMol does not require any software to be downloaded and is cross-browser compatible. EzMol is designed for occasional users and does not require commands to be memorized.
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