MPRAbase: A Massively Parallel Reporter Assay Database.
MPRAbase: A Massively Parallel Reporter Assay Database.
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MPRAbase：大规模并行报告分析数据库。
DOI：
10.1101/2023.11.19.567742
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发表时间：
2023
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Ahituv,Nadav
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhao,Jingjing;Baltoumas,FotisA;Konnaris,MaxwellA;Mouratidis,Ioannis;Liu,Zhe;Sims,Jasmine;Agarwal,Vikram;Pavlopoulos,GeorgiosA;Georgakopoulos-Soares,Ilias;Ahituv,Nadav
大规模平行报告基因分析（MPRA）是一组高通量技术，可测量数千个序列/变体对基因调控活性的功能影响。MPRA技术有几种不同的变体，它们用于许多应用，包括调控元件发现、变体效应测量、饱和诱变、合成调控元件生成或进化基因调控差异的表征。尽管它们有许多设计和用途，但没有综合数据库来整合这些实验的结果。为了解决这个问题，我们开发了MPRAbase，这是一个手动管理的数据库，目前包含130个实验，包括在35种细胞类型和4种生物体中测试的17，718，677个元素。MPRAbase网络界面作为一个集中的用户友好的存储库，在线检查跨细胞类型和生物体的调节元件的活动，并下载MPRA数据进行独立分析。
Massively parallel reporter assays (MPRAs) represent a set of high-throughput technologies that measure the functional effects of thousands of sequences/variants on gene regulatory activity. There are several different variations of MPRA technology and they are used for numerous applications, including regulatory element discovery, variant effect measurement, saturation mutagenesis, synthetic regulatory element generation or characterization of evolutionary gene regulatory differences. Despite their many designs and uses, there is no comprehensive database that incorporates the results of these experiments. To address this, we developed MPRAbase, a manually curated database that currently harbors 130 experiments, encompassing 17,718,677 elements tested across 35 cell types and 4 organisms. The MPRAbase web interface serves as a centralized user-friendly repository to examine online the activity of regulatory elements across cell types and organisms, and to download MPRA data for independent analysis.
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果蝇的 67B 位点包含七个而不是四个密切相关的热休克基因。
影响因子：
11.4
作者：
A. Ayme;A. Tissières
通讯作者：
A. Tissières
DOI：
10.1073/pnas.81.22.6958
发表时间：
1984-01-01
期刊：
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA-BIOLOGICAL SCIENCES
影响因子：
--
作者：
FLEISCHMANN, G;PFLUGFELDER, G;ELGIN, SCR
通讯作者：
ELGIN, SCR
转录活性染色质对粗糙脉孢菌和 S1 核酸酶敏感。
影响因子：
5.6
作者：
S. Han;A. Udvardy;P. Schedl
通讯作者：
P. Schedl
果蝇 DNA 拓扑异构酶 II 的多种形式和细胞定位。
DOI：
--
发表时间：
1986
期刊：
The Journal of biological chemistry
影响因子：
--
作者：
Heller,RA;Shelton,ER;Dietrich,V;Elgin,SC;Brutlag,DL
通讯作者：
Brutlag,DL
果蝇胚胎染色体代谢的电子显微镜分析。
DOI：
--
发表时间：
1978
期刊：
Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology
影响因子：
--
作者：
S. McKnight;M. Bustin;O. Miller
通讯作者：
O. Miller