Characterization of the complete chloroplast genome of Leptochilus decurrens (Polypodiaceae), a least concern folk medicinal fern.
Characterization of the complete chloroplast genome of Leptochilus decurrens (Polypodiaceae), a least concern folk medicinal fern.
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Leptochilus decurrens（水龙骨科）完整叶绿体基因组的表征，一种最不受关注的民间药用蕨类植物
DOI：
10.1080/23802359.2019.1673243
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发表时间：
2019-10-04
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Wang T
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Su Y;He Z;Wang Z;Hong Y;Wang T
细唇兰是水龙骨科热带小型蕨类植物，也是民间最不受关注的药用蕨类植物。其基因组大小为153，753 bp，具有一对21，664 bp的反向重复区（IR），一个84，395 bp的大单拷贝（LSC）区和一个26，030 bp的小单拷贝（SSC）区。共预测了133个基因，其中蛋白质编码基因88个，tRNA基因37个，rRNA基因8个。ML分析表明L. decurrens是半裂叶唇兰Leptochilus hemionitideus的姐妹，形成与水龙骨科蕨类植物密切相关的单系类群。本研究为进一步促进水龙骨科植物的遗传学研究提供了有力的分子数据。
Leptochilus decurrens is a small tropical fern of Polypodiaceae, but also a least concern folk medicinal fern. Its genome size is 153,753 bp with a pair of 21,664 bp inverted repeat regions (IR), a large single-copy (LSC) region of 84,395 bp and a small single-copy (SSC) region of 26,030 bp. A total of 133 genes were predicted, including 88 protein-coding genes, 37 tRNA genes and eight rRNA genes. The ML analysis reveals that L. decurrens is sister to Leptochilus hemionitideus forming monophyletic group closely related with polypodiaceous ferns. The work provides vigorous molecular data to further promote phylogenetics of Polypodiaceae.
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影响因子：
5.8
作者：
Wyman, SK;Jansen, RK;Boore, JL
通讯作者：
Boore, JL
影响因子：
10.7
作者：
Katoh K;Standley DM
通讯作者：
Standley DM
Trimmomatic：用于 Illumina 序列数据的灵活修剪器。
DOI：
10.1093/bioinformatics/btu170
发表时间：
2014-08-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Bolger AM;Lohse M;Usadel B
通讯作者：
Usadel B
影响因子：
7
作者：
Zerbino, Daniel R.;Birney, Ewan
通讯作者：
Birney, Ewan
DOI：
10.1093/bioinformatics/btu033
发表时间：
2014-05-01
期刊：
Bioinformatics (Oxford, England)
影响因子：
--
作者：
Stamatakis A
通讯作者：
Stamatakis A