Single-cell isolation by a modular single-cell pipette for RNA-sequencing.
Single-cell isolation by a modular single-cell pipette for RNA-sequencing.
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DOI：
10.1039/c6lc01241h
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发表时间：
2016-11-29
期刊：
影响因子：
6.1
通讯作者：
Qin L
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Zhang K;Gao M;Chong Z;Li Y;Han X;Chen R;Qin L
单细胞转录组测序非常需要一种方便可靠的方法来快速将活细胞分离到特定的容器（例如 PCR 管）中。在这里，我们报告了一种模块化单细胞移液器（mSCP），由三个模块化组件组成：SCP-Tip、排气移液器（ADP）和 ADP-Tips，可以轻松组装、拆卸和重新组装。通过组装包含流体动力学陷阱的 SCP-Tip，mSCP 可以从 5-10 个细胞/μL 细胞悬浮液中分离出单个细胞。 mSCP兼容捕获的单细胞的显微识别，最终实现100%的单细胞分离效率。分离的活单细胞体积为亚微升，非常适合单细胞 PCR 分析和 RNA 测序。 mSCP具有方便、快速、高效的优点，是分离单细胞进行转录组分析的有力工具。我们报告了一种模块化单细胞移液器（mSCP），由排气移液器（ADP）、ADP-Tips 和 SCP-Tip 组成，及其在 RNA 测序的单细胞分离中的应用。
Single-cell transcriptome sequencing highly requires a convenient and reliable method to rapidly isolate a live cell into a specific container such as a PCR tube. Here, we report a modular Single-Cell Pipette (mSCP) consisting of three modular components, SCP-Tip, Air-Displacement Pipette (ADP), and ADP-Tips, that can be easily assembled, disassembled, and reassembled. By assembling the SCP-Tip containing a hydrodynamic trap, the mSCP can isolate single cells from 5–10 cells/μL cell suspension. The mSCP is compatible with microscopic identification of captured single cells to finally achieve 100% single-cell isolation efficiency. The isolated live single cells are in submicroliter volumes and well suitable for single-cell PCR analysis and RNA-sequencing. The mSCP possesses merits of convenience, rapidness, and high-efficiency, which is a powerful tool to isolate single cells for transcriptome analysis. We report a modular Single-Cell Pipette (mSCP), consisting of Air-Displacement Pipette (ADP), ADP-Tips, and SCP-Tip, and its application in single-cell isolation for RNA-sequencing.
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