Computational Modeling of Glycan Processing in the Golgi for Investigating Changes in the Arrangements of Biosynthetic Enzymes.
Computational Modeling of Glycan Processing in the Golgi for Investigating Changes in the Arrangements of Biosynthetic Enzymes.
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高尔基体中聚糖加工的计算模型，用于研究生物合成酶排列的变化。
DOI：
10.1007/978-1-0716-1685-7_10
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发表时间：
2022
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
West B
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
West B
由于糖基化可以表现出从病理学到生物制药制造的深远影响，建模聚糖生物合成变得越来越重要。在这里，我们描述了一种随机模拟方法，以克服以前的模型的确定性，其目的是模拟聚糖修饰酶的作用，以产生一个聚糖配置文件。这是再加上一个近似贝叶斯计算方法，以系统地适应经验数据，以确定哪一组参数充分描述了组织内的高尔基体酶。该模型详细描述了沿着的概念和治疗应用程序的证明。
Modeling glycan biosynthesis is becoming increasingly important due to the far-reaching implications that glycosylation can exhibit, from pathologies to biopharmaceutical manufacturing. Here we describe a stochastic simulation approach, to overcome the deterministic nature of previous models, that aims to simulate the action of glycan modifying enzymes to produce a glycan profile. This is then coupled with an approximate Bayesian computation methodology to systematically fit to empirical data in order to determine which set of parameters adequately describes the organization of enzymes within the Golgi. The model is described in detail along with a proof of concept and therapeutic applications.
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影响因子：
8.4
作者：
Spahn, Philipp N.;Hansen, Anders H.;Hansen, Henning G.;Arnsdorf, Johnny;Kildegaard, Helene F.;Lewis, Nathan E.
通讯作者：
Lewis, Nathan E.
影响因子：
3.8
作者：
Sou SN;Jedrzejewski PM;Lee K;Sellick C;Polizzi KM;Kontoravdi C
通讯作者：
Kontoravdi C
影响因子：
3
作者：
Takahashi, M;Tsuda, T;Taniguchi, N
通讯作者：
Taniguchi, N
DOI：
10.1016/j.tig.2018.03.002
发表时间：
2018-06
期刊：
Trends in genetics : TIG
影响因子：
--
作者：
Ng BG;Freeze HH
通讯作者：
Freeze HH
影响因子：
4.3
作者：
Wada, Yoshinao;Azadi, Parastoo;Taniguchi, Naoyuki
通讯作者：
Taniguchi, Naoyuki