The complete chloroplast genome sequence of Vitis berlandieri.
The complete chloroplast genome sequence of Vitis berlandieri.
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伯兰蒂葡萄 (Vitis berlandieri) 叶绿体基因组完整序列
DOI：
10.1080/23802359.2020.1797566
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发表时间：
2020-07-29
期刊：
影响因子：
--
通讯作者：
Wu J
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Xiang J;Cheng J;Wei L;Cui P;Li M;Wu J
摘要葡萄属葡萄是原产于北美南部的一种葡萄，因其对石灰含量高的土壤具有良好的耐受性而被广泛用于砧木育种。在这里，我们报告了完整的叶绿体基因组V. berlandieri。叶绿体基因组长度为161，028 bp，包含一个大的单拷贝区（89，228 bp）和一个小的单拷贝区（19，028 bp），由两个反向重复区隔开。从该基因组中共鉴定出130个独特的基因，包括85个蛋白质编码基因（PCG），37个tRNA基因和8个rRNA基因。叶绿体系统发育分析表明，贝兰迪耶里与心叶葡萄亲缘关系最近。
Abstract Vitis berlandieri, a species of grape native to the southern North America, is known for good tolerance against soils with a high content of lime and was almost used for rootstock breeding. Here, we report the complete chloroplast genome of V. berlandieri. The chloroplast genome was 161,028 bp in length, harboring a large single-copy region (89,228 bp) and a small single-copy region (19,028 bp) separated by two inverted repeat regions. A total of 130 unique genes were identified from this genome, including 85 protein-coding genes (PCGs), 37 tRNA genes, and 8 rRNA genes. Chloroplast phylogenetic analysis revealed that V. berlandieri is closely related to V. cordifolia.
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10.21273/jashs.121.6.1020
发表时间：
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Lamikanra, O