MNDR v2.0: an updated resource of ncRNA-disease associations in mammals.
MNDR v2.0: an updated resource of ncRNA-disease associations in mammals.
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MNDR v2.0：哺乳动物 ncRNA 疾病关联的更新资源
DOI：
10.1093/nar/gkx1025
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发表时间：
2018-01-04
影响因子：
14.9
通讯作者：
Wang D
中科院分区：
文献类型：
--
作者：
Cui T;Zhang L;Huang Y;Yi Y;Tan P;Zhao Y;Hu Y;Xu L;Li E;Wang D
越来越多的证据表明，不同的非编码RNA（ncRNA）参与了各种疾病的进展。近年来，大量的ncRNA与疾病的关联被发现并通过实验和预测算法得到了预测。不同的ncRNA疾病协会分散在许多资源和哺乳动物，而不同的ncRNA疾病协会的全球观点是不适用于任何哺乳动物。因此，我们更新了MNDR v2.0数据库（www.rna-society.org/mndr/），在一个共同的框架下整合了来自手动文献策展和其他资源的实验和预测关联。MNDR v2.0的新发展包括：（i）与先前版本相比，ncRNA-疾病关联增强增加了220倍以上（包括lncRNA、miRNA、皮尔纳、snoRNA和1400多种疾病）;（ii）整合来自14种资源的实验和预测证据以及每个ncRNA与疾病关联的预测算法;（iii）将疾病名称映射到疾病本体和医学主题词（MeSH）;（iv）为每个ncRNA-疾病关联提供置信度评分;（v）将物种覆盖范围增加到6种哺乳动物。最后，MNDR v2.0旨在为科学界提供有效浏览和提取不同ncRNA与疾病之间关联的资源，包括>260 000个ncRNA-疾病关联。
Accumulating evidence suggests that diverse non-coding RNAs (ncRNAs) are involved in the progression of a wide variety of diseases. In recent years, abundant ncRNA–disease associations have been found and predicted according to experiments and prediction algorithms. Diverse ncRNA–disease associations are scattered over many resources and mammals, whereas a global view of diverse ncRNA–disease associations is not available for any mammals. Hence, we have updated the MNDR v2.0 database (www.rna-society.org/mndr/) by integrating experimental and prediction associations from manual literature curation and other resources under one common framework. The new developments in MNDR v2.0 include (i) an over 220-fold increase in ncRNA–disease associations enhancement compared with the previous version (including lncRNA, miRNA, piRNA, snoRNA and more than 1400 diseases); (ii) integrating experimental and prediction evidence from 14 resources and prediction algorithms for each ncRNA–disease association; (iii) mapping disease names to the Disease Ontology and Medical Subject Headings (MeSH); (iv) providing a confidence score for each ncRNA–disease association and (v) an increase of species coverage to six mammals. Finally, MNDR v2.0 intends to provide the scientific community with a resource for efficient browsing and extraction of the associations between diverse ncRNAs and diseases, including >260 000 ncRNA–disease associations.
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